Použití IS na řízení výuky ovšem neřeší vlastní technické problémy vývoje:
obrovská heterogenita používaných nástrojů, technologií
obtížná konzultovatelnost technických problémů
špatná reprodukovatelnost výstupů - produkt často "chodil" jen na soukromém počítači řešitele nebo jen na jeho vlastním účtu
praktická nemožnost na projekt navázat nebo i výsledky znovupoužít