| Údaje o výsledku |
| Identifikační kód | RIV/00216224:14330/13:00066842 |
| Název v původním jazyce | Preferential Binding of Hot Spot Mutant p53 Proteins to Supercoiled DNA In Vitro and in Cells |
| Druh | J - Článek v odborném periodiku |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor | EB - Genetika a molekulární biologie |
| Rok uplatnění | 2013 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů |
| Počet výskytů výsledku | 8 |
| Údaje z Hodnocení výsledků výzkumných organizací 2014 |
| Výsledek byl hodnocen v Pilíři I |
| Rozsah vyřazení výsledku | Tento výskyt výsledku není vyřazen |
| Zařazení výsledku v hodnocení | Jimp - Článek v impaktovaném časopise evidovaném ve Web of Science |
| Skupina oboru v hodnocení | 10 - Biologické vědy |
| Konkrétní způsob(y) hodnocení výsledku | Článek v impaktovaném časopise evidovaném ve Web of Science |
| Bodové ohodnocení | 88,419 |
| Faktor korekce | 94,2 % |
| Body (upravené podle přílohy č. 8 Metodiky) | 83,312 |
| Rozdělení výsledku mezi předkladatele |
| Organizace | Výzkumná organizace? | Podíl | Body | Body (upravené podle přílohy č. 8 Metodiky) |
|---|
| Masarykův onkologický ústav | ano | 17,4 % | 15,377 | 14,489 |
| Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i. | ano | 52,2 % | 46,132 | 43,467 |
| Masarykova univerzita / Fakulta informatiky | ano | 21,7 % | 19,221 | 18,111 |
| Ostravská univerzita v Ostravě / Přírodovědecká fakulta | ano | 4,3 % | 3,844 | 3,622 |
|
| Tvůrci výsledku |
| Počet tvůrců celkem | 12 |
| Počet domácích tvůrců | 4 |
| Tvůrce | Brázdová Marie (státní příslušnost: CZ - Česká republika; vedidk: 8312095) |
| Tvůrce | Navrátilová Lucie (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Tvůrce | Tichý Vlastimil (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce; vedidk: 1774352) |
| Tvůrce | Němcová Kateřina (státní příslušnost: CZ - Česká republika; vedidk: 8279942) |
| Tvůrce | Lexa Matej (státní příslušnost: SK - Slovenská republika; A - domácí tvůrce; vedidk: 6759890) |
| Tvůrce | Hrstka Roman (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Tvůrce | Pecinka Petr (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Tvůrce | Adámik Matej (státní příslušnost: SK - Slovenská republika; A - domácí tvůrce; vedidk: 7209568) |
| Tvůrce | Vojtěšek Bořivoj (státní příslušnost: CZ - Česká republika; vedidk: 9637419) |
| Tvůrce | Palecek Emil (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Tvůrce | Deppert Wolfgang (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo) |
| Tvůrce | Fojta Miroslav (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce; vedidk: 4171373) |
| Údaje blíže specifikující výsledek |
| Popis v původním jazyce | Hot spot mutant p53 (mutp53) proteins exert oncogenic gain-of-function activities. Binding of mutp53 to DNA is assumed to be involved in mutp53-mediated repression or activation of several mutp53 target genes. To investigate the importance of DNA topology on mutp53-DNA recognition in vitro and in cells, we analyzed the interaction of seven hot spot mutp53 proteins with topologically different DNA substrates (supercoiled, linear and relaxed) containing and/or lacking mutp53 binding sites (mutp53BS) using a variety of electrophoresis and immunoprecipitation based techniques. All seven hot spot mutp53 proteins (R175H, G245S, R248W, R249S, R273C, R273H and R282W) were found to have retained the ability of wild-type p53 to preferentially bind circular DNA at native negative superhelix density, while linear or relaxed circular DNA was a poor substrate. |
| Klíčová slova | p53 tumor supressor; mutp53 oncogenic mutations; DNA topology; superhelicity; DNA binding; BAX MSP/MST1 promoter |
| Kód UT ISI | 000317418500055 |
| Název periodka | Plos One |
| Rozsah stran | "e59567" |
| ISSN | 1932-6203 |
| Svazek periodika | 8 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 3 |
| Stát vydavatele periodika | US - Spojené státy americké |
| Počet stran výsledku | 17 |
| Adresa www stránky s výsledkem | http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0059567 |
| DOI výsledku | 10.1371/journal.pone.0059567 |
| Údaje o tomto záznamu o výsledku |
| Předkladatel | Masarykova univerzita / Fakulta informatiky |
| Dodavatel | GA0 - Grantová agentura České republiky (GA ČR) |
| Rok sběru | 2014 |
| Systémové označení dodávky dat | RIV14-GA0-14330___/01:1 |
| Specifikace | RIV/00216224:14330/13:00066842!RIV14-GA0-14330___ |
| Kontrolní kód | [C5E565B538CB] |
| Další výskyty tohoto výsledku od jiných předkladatelů |
| Další předkladatel | Masarykův onkologický ústav |
| Dodáno GA ČR v roce 2014 | Záznam s identifikačním kódem RIV/00209805:_____/13:#0000409 v dodávce dat RIV14-GA0-00209805/01:1 |
| Dodáno MŠMT v roce 2014 | Záznam s identifikačním kódem RIV/00209805:_____/13:#0000409 v dodávce dat RIV14-MSM-00209805/01:1 |
| Dodáno MZ v roce 2014 | Záznam s identifikačním kódem RIV/00209805:_____/13:#0000409 v dodávce dat RIV14-MZ0-00209805/01:1 |
| Další předkladatel | Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i. |
| Dodáno AV ČR v roce 2014 | Záznam s identifikačním kódem RIV/68081707:_____/13:00392686 v dodávce dat RIV14-AV0-68081707/01:1 |
| Dodáno GA ČR v roce 2014 | Záznam s identifikačním kódem RIV/68081707:_____/13:00392686 v dodávce dat RIV14-GA0-68081707/01:1 |
| Dodáno MŠMT v roce 2014 | Záznam s identifikačním kódem RIV/68081707:_____/13:00392686 v dodávce dat RIV14-MSM-68081707/01:1 |
| Další předkladatel | Ostravská univerzita v Ostravě / Přírodovědecká fakulta |
| Dodáno MŠMT v roce 2014 | Záznam s identifikačním kódem RIV/61988987:17310/13:A1401ASV v dodávce dat RIV14-MSM-17310___/01:1 |
| Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl |
| Projekt | ED2.1.00/03.0100 - Institut environmentálních technologií (2011-2013, MSM/ED) |
| Projekt | ED2.1.00/03.0101 - Regionální centrum aplikované molekulární onkologie (RECAMO) (2011-2014, MSM/ED) |
| Projekt | GAP301/10/2370 - Úloha strukturně selektivní vazby proteinu p53 k DNA u nádorů mozku (2010-2012, GA0/GA) |
| Projekt | GAP301/11/1678 - Úloha chaperonového systému v maligní transformaci a odpovědi na protinádorovou terapii (2011-2015, GA0/GA) |
| Projekt | GAP301/11/2055 - Nové metody analýzy bílkovin a jejich glykosylace v rakovině - kombinace elektrochemie, mikrofludických biosenzorů a hmotnostní spektrometrie. (2011-2014, GA0/GA) |
| Projekt | GA13-36108S - Interakce proteinů rodiny p53 s biologicky významnými kvadruplexy DNA (2013-2015, GA0/GA) |
| Projekt | GA204/08/1560 - Bioinformatická a experimentální identifikace nekanonických struktur v genomové DNA (2008-2010, GA0/GA) |
| Projekt | GP204/06/P369 - DNA vytvářející triplexy a jejich interakce s proteiny p53 (2006-2008, GA0/GP) |
| Projekt | NT13794 - Analýza chaperonového systému a indentifikace nových biomarkerů u gynekologických malignit (2012-2015, MZ0/NT) |
| Projekt | 1K04119 - Interakce mutantních proteinů p53 s genomovou DNA in vitro a in vivo (2004-2007, MSM/1K) |
| Výzkumný záměr | AV0Z50040702 - Genom a epigenom: 1D a 3D struktura, dynamika, interakce s proteiny a funkce (2007-2013, AV0) |