| Údaje o výsledku |
| Identifikační kód | RIV/00209805:_____/13:#0000409 |
| Název v původním jazyce | Preferential binding of hot spot mutant p53 proteins to supercoiled DNA in vitro and in cells |
| Druh | J - Článek v odborném periodiku |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor | EB - Genetika a molekulární biologie |
| Rok uplatnění | 2013 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů |
| Počet výskytů výsledku | 8 |
| Údaje z Hodnocení výsledků výzkumných organizací 2014 |
| Výsledek byl hodnocen v Pilíři I |
| Rozsah vyřazení výsledku | Tento výskyt výsledku není vyřazen |
| Zařazení výsledku v hodnocení | Jimp - Článek v impaktovaném časopise evidovaném ve Web of Science |
| Skupina oboru v hodnocení | 10 - Biologické vědy |
| Konkrétní způsob(y) hodnocení výsledku | Článek v impaktovaném časopise evidovaném ve Web of Science |
| Bodové ohodnocení | 88,419 |
| Faktor korekce | 94,2 % |
| Body (upravené podle přílohy č. 8 Metodiky) | 83,312 |
| Rozdělení výsledku mezi předkladatele |
| Organizace | Výzkumná organizace? | Podíl | Body | Body (upravené podle přílohy č. 8 Metodiky) |
|---|
| Masarykův onkologický ústav | ano | 17,4 % | 15,377 | 14,489 |
| Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i. | ano | 52,2 % | 46,132 | 43,467 |
| Masarykova univerzita / Fakulta informatiky | ano | 21,7 % | 19,221 | 18,111 |
| Ostravská univerzita v Ostravě / Přírodovědecká fakulta | ano | 4,3 % | 3,844 | 3,622 |
|
| Tvůrci výsledku |
| Počet tvůrců celkem | 12 |
| Počet domácích tvůrců | 2 |
| Tvůrce | Hrstka Roman (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce; vedidk: 1330586) |
| Tvůrce | Vojtěšek Bořivoj (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce; vedidk: 9637419) |
| Údaje blíže specifikující výsledek |
| Popis v původním jazyce | Hot spot mutant p53 (mutp53) proteins exert oncogenic gain-of-function activities. Binding of mutp53 to DNA is assumed to be involved in mutp53-mediated repression or activation of several mutp53 target genes. To investigate the importance of DNA topology on mutp53-DNA recognition in vitro and in cells, we analyzed the interaction of seven hot spot mutp53 proteins with topologically different DNA substrates (supercoiled, linear and relaxed) containing and/or lacking mutp53 binding sites (mutp53BS) using a variety of electrophoresis and immunoprecipitation based techniques. All seven hot spot mutp53 proteins (R175H, G245S, R248W, R249S, R273C, R273H and R282W) were found to have retained the ability of wildtype p53 to preferentially bind circular DNA at native negative superhelix density, while linear or relaxed circular DNA was a poor substrate. The preference of mutp53 proteins for supercoiled DNA (supercoil-selective binding) was further substantiated by competition experiments with linear DNA or relaxed DNA in vitro and ex vivo. Using chromatin immunoprecipitation, the preferential binding of mutp53 to a sc mutp53BS was detected also in cells. Furthermore, we have shown by luciferase reporter assay that the DNA topology influences p53 regulation of BAX and MSP/MST1 promoters. Possible modes of mutp53 binding to topologically constrained DNA substrates and their biological consequences are discussed. |
| Klíčová slova | mutp53; supercoiled DNA; DNA structure |
| Kód UT ISI | 000317418500055 |
| Název periodka | PLoS ONE |
| Rozsah stran | "e59567" |
| ISSN | 1932-6203 |
| Svazek periodika | 8 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 3 |
| Stát vydavatele periodika | US - Spojené státy americké |
| Počet stran výsledku | 17 |
| Adresa www stránky s výsledkem | http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0059567 |
| DOI výsledku | 10.1371/journal.pone.0059567 |
| Údaje o tomto záznamu o výsledku |
| Předkladatel | Masarykův onkologický ústav |
| Dodavatel | MZ0 - Ministerstvo zdravotnictví (MZ) |
| Rok sběru | 2014 |
| Systémové označení dodávky dat | RIV14-MZ0-00209805/01:1 |
| Specifikace | RIV/00209805:_____/13:#0000409!RIV14-MZ0-00209805 |
| Kontrolní kód | [FBBED1EAAA04] |
| Další výskyty tohoto výsledku od stejného předkladatele |
| Dodáno GA ČR v roce 2014 | Záznam s identifikačním kódem RIV/00209805:_____/13:#0000409 v dodávce dat RIV14-GA0-00209805/01:1 |
| Dodáno MŠMT v roce 2014 | Záznam s identifikačním kódem RIV/00209805:_____/13:#0000409 v dodávce dat RIV14-MSM-00209805/01:1 |
| Další výskyty tohoto výsledku od jiných předkladatelů |
| Další předkladatel | Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i. |
| Dodáno AV ČR v roce 2014 | Záznam s identifikačním kódem RIV/68081707:_____/13:00392686 v dodávce dat RIV14-AV0-68081707/01:1 |
| Dodáno GA ČR v roce 2014 | Záznam s identifikačním kódem RIV/68081707:_____/13:00392686 v dodávce dat RIV14-GA0-68081707/01:1 |
| Dodáno MŠMT v roce 2014 | Záznam s identifikačním kódem RIV/68081707:_____/13:00392686 v dodávce dat RIV14-MSM-68081707/01:1 |
| Další předkladatel | Masarykova univerzita / Fakulta informatiky |
| Dodáno GA ČR v roce 2014 | Záznam s identifikačním kódem RIV/00216224:14330/13:00066842 v dodávce dat RIV14-GA0-14330___/01:1 |
| Další předkladatel | Ostravská univerzita v Ostravě / Přírodovědecká fakulta |
| Dodáno MŠMT v roce 2014 | Záznam s identifikačním kódem RIV/61988987:17310/13:A1401ASV v dodávce dat RIV14-MSM-17310___/01:1 |
| Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl |
| Projekt | ED2.1.00/03.0100 - Institut environmentálních technologií (2011-2013, MSM/ED) |
| Projekt | ED2.1.00/03.0101 - Regionální centrum aplikované molekulární onkologie (RECAMO) (2011-2014, MSM/ED) |
| Projekt | GAP301/10/2370 - Úloha strukturně selektivní vazby proteinu p53 k DNA u nádorů mozku (2010-2012, GA0/GA) |
| Projekt | GAP301/11/1678 - Úloha chaperonového systému v maligní transformaci a odpovědi na protinádorovou terapii (2011-2015, GA0/GA) |
| Projekt | GAP301/11/2055 - Nové metody analýzy bílkovin a jejich glykosylace v rakovině - kombinace elektrochemie, mikrofludických biosenzorů a hmotnostní spektrometrie. (2011-2014, GA0/GA) |
| Projekt | GA13-36108S - Interakce proteinů rodiny p53 s biologicky významnými kvadruplexy DNA (2013-2015, GA0/GA) |
| Projekt | GA204/08/1560 - Bioinformatická a experimentální identifikace nekanonických struktur v genomové DNA (2008-2010, GA0/GA) |
| Projekt | GP204/06/P369 - DNA vytvářející triplexy a jejich interakce s proteiny p53 (2006-2008, GA0/GP) |
| Projekt | NT13794 - Analýza chaperonového systému a indentifikace nových biomarkerů u gynekologických malignit (2012-2015, MZ0/NT) |
| Projekt | 1K04119 - Interakce mutantních proteinů p53 s genomovou DNA in vitro a in vivo (2004-2007, MSM/1K) |
| Výzkumný záměr | AV0Z50040702 - Genom a epigenom: 1D a 3D struktura, dynamika, interakce s proteiny a funkce (2007-2013, AV0) |