Identifikační kód | RIV/00216224:14330/13:00070435 |
Název v anglickém jazyce | Esther: Introducing an Online Platform for Parameter Identification of Boolean Networks |
Druh | D - Článek ve sborníku |
Jazyk | eng - angličtina |
Obor - skupina | I - Informatika |
Obor | IN - Informatika |
Rok uplatnění | 2013 |
Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
Počet výskytů výsledku | 1 |
Počet tvůrců celkem | 4 |
Počet domácích tvůrců | 3 |
Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Adam Streck (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6717020) Juraj Kolčák (státní příslušnost: SK - Slovenská republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 1045709) Heike Siebert (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo) David Šafránek (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 8225400) |
Popis výsledku v anglickém jazyce | When trying to uncover the nature of gene regulatory and signaling networks, the modelers currently have a zoo of inference algorithms at their disposal. These algorithms are very useful for converting raw experimental data into mathematical models of various nature ? from pure differential equations to very abstract, logical causal networks. However, the algorithms rarely permit refitting of the network based on new data, and further enhancements are commonly done by hand, with quality of the process dependent on the experience of the modeler. We are therefore focusing on development of an environment that works with high level causal models and allows for automated comparison of the properties of the model and the behavior measured or observed in themodeled system. Since we expect the models to have wide range of possible kinetic parameters, we also provide means of manipulating with sets of parametrizations of the model, e.g. their ranking w.r.t. |
Klíčová slova oddělená středníkem | systems biology; boolean networks; model checking |
Stránka www, na které se nachází výsledek | - |