Automatic Quantification of Filopodia-Based Cell Migration (2013)výskyt výsledku
| Identifikační kód | RIV/00216224:14330/13:00068040 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | Automatic Quantification of Filopodia-Based Cell Migration |
| Druh | D - Článek ve sborníku |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor - skupina | I - Informatika |
| Obor | IN - Informatika |
| Rok uplatnění | 2013 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 1 |
| Počet tvůrců celkem | 5 |
| Počet domácích tvůrců | 1 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Martin Maška (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 9021094) Xabier Morales (státní příslušnost: ES - Španělské království) Arrate Mu?oz-Barrutia (státní příslušnost: ES - Španělské království) Ana Rouzaut (státní příslušnost: ES - Španělské království) Carlos Ortiz-de-Solórzano (státní příslušnost: ES - Španělské království) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | We present a fully automatic approach to quantitatively analyze filopodia-based migration of fluorescent cells in 3D time-lapse series. The proposed method involves three steps. First, each frame of the time-lapse series is preprocessed using a steerablefilter and binarized to obtain a coarse segmentation of the cell shape. Second, a sequence of morphological filters is applied on the coarse binary mask to separate the cell body from individual filopodia. Finally, their length is estimated using a geodesic distance transform. The proposed approach is validated on 3D time-lapse series of lung adenocarcinoma cells. We show that the number of filopodia and their average length can be used as a descriptor to discriminate between different phenotypes of migrating cells. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | Filopodium segmentation; fluorescence microscopy; steerable filtering; geodesic distance |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
| DOI výsledku | 10.1109/ISBI.2013.6556563 |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název sborníku | 10th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging |
|---|---|
| ISBN | 9781467364546 |
| ISSN | 1945-7928 |
| Počet stran výsledku | 4 |
| Strana od-do | 668-671 |
| Název nakladatele | IEEE |
| Místo vydání | San Francisco |
| Místo konání akce | San Francisco |
| Datum konání akce | 07.04.2013 |
| Typ akce podle státní příslušnosti účastníků | WRD - Celosvětová |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000326900100167 |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Masarykova univerzita / Fakulta informatiky |
|---|---|
| Dodavatel | MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Rok sběru | 2014 |
| Specifikace | RIV/00216224:14330/13:00068040!RIV14-MSM-14330___ |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 29.05.2014 |
| Kontrolní číslo | 56537049 |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Projekt podporovaný MŠMT v programu EE | EE2.3.30.0009 - Zaměstnáním čerstvých absolventů doktorského studia k vědecké excelenci (2012 - 2015) |
|---|