| Údaje o výsledku |
| Identifikační kód | RIV/00216224:14330/13:00068040 |
| Název v původním jazyce | Automatic Quantification of Filopodia-Based Cell Migration |
| Druh | D - Článek ve sborníku |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor | IN - Informatika |
| Rok uplatnění | 2013 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů |
| Počet výskytů výsledku | 1 |
| Údaje z Hodnocení výsledků výzkumných organizací 2014 |
| Výsledek byl hodnocen v Pilíři I |
| Rozsah vyřazení výsledku | Tento výskyt výsledku není vyřazen |
| Zařazení výsledku v hodnocení | D - Článek ve sborníku |
| Skupina oboru v hodnocení | 04 - Technické a informatické vědy |
| Konkrétní způsob(y) hodnocení výsledku | Článek ve sborníku evidovaném v databázi Scopus |
| Bodové ohodnocení | 8,000 |
| Faktor korekce | 50,1 % |
| Body (upravené podle přílohy č. 8 Metodiky) | 4,009 |
| Rozdělení výsledku mezi předkladatele |
| Organizace | Výzkumná organizace? | Podíl | Body | Body (upravené podle přílohy č. 8 Metodiky) |
|---|
| Masarykova univerzita / Fakulta informatiky | ano | 33,3 % | 2,667 | 1,336 |
|
| Tvůrci výsledku |
| Počet tvůrců celkem | 5 |
| Počet domácích tvůrců | 1 |
| Tvůrce | Maška Martin (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce; vedidk: 9021094) |
| Tvůrce | Morales Xabier (státní příslušnost: ES - Španělské království) |
| Tvůrce | Muñoz-Barrutia Arrate (státní příslušnost: ES - Španělské království) |
| Tvůrce | Rouzaut Ana (státní příslušnost: ES - Španělské království) |
| Tvůrce | Ortiz-de-Solórzano Carlos (státní příslušnost: ES - Španělské království) |
| Údaje blíže specifikující výsledek |
| Popis v původním jazyce | We present a fully automatic approach to quantitatively analyze filopodia-based migration of fluorescent cells in 3D time-lapse series. The proposed method involves three steps. First, each frame of the time-lapse series is preprocessed using a steerable filter and binarized to obtain a coarse segmentation of the cell shape. Second, a sequence of morphological filters is applied on the coarse binary mask to separate the cell body from individual filopodia. Finally, their length is estimated using a geodesic distance transform. The proposed approach is validated on 3D time-lapse series of lung adenocarcinoma cells. We show that the number of filopodia and their average length can be used as a descriptor to discriminate between different phenotypes of migrating cells. |
| Klíčová slova | Filopodium segmentation; fluorescence microscopy; steerable filtering; geodesic distance |
| Kód UT ISI | 000326900100167 |
| Název sborníku | 10th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging |
| Rozsah stran | 668-671 |
| Forma vydání | E - Elektronická verze „online“ |
| ISSN | 1945-7928 |
| ISBN | 9781467364546 |
| Počet stran výsledku | 4 |
| Název nakladatele | IEEE |
| Místo vydání | San Francisco |
| Místo konání akce | San Francisco |
| Datum zahájení akce | 7.4.2013 |
| Typ akce podle státní příslušnoti účastníků | WRD - Světová |
| DOI výsledku | 10.1109/ISBI.2013.6556563 |
| Údaje o tomto záznamu o výsledku |
| Předkladatel | Masarykova univerzita / Fakulta informatiky |
| Dodavatel | MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Rok sběru | 2014 |
| Systémové označení dodávky dat | RIV14-MSM-14330___/01:1 |
| Specifikace | RIV/00216224:14330/13:00068040!RIV14-MSM-14330___ |
| Kontrolní kód | [8DBFC14B4ADC] |
| Jiný výskyt tohoto výsledku se v RIV nenachází |
| Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl |
| Projekt | EE2.3.30.0009 - Zaměstnáním čerstvých absolventů doktorského studia k vědecké excelenci (2012-2015, MSM/EE) |