| Identifikační kód | RIV/00216224:14330/11:00050002 |
|---|
| Název v anglickém jazyce | Architecture Model for Approximate Tandem Repeat Detection |
|---|
| Druh | D - Článek ve sborníku |
|---|
| Jazyk | eng - angličtina |
|---|
| Obor - skupina | I - Informatika |
|---|
| Obor | IN - Informatika |
|---|
| Rok uplatnění | 2011 |
|---|
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
|---|
| Počet výskytů výsledku | 3 |
|---|
| Počet tvůrců celkem | 2 |
|---|
| Počet domácích tvůrců | 1 |
|---|
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Tomáš Martínek (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 4123484)
Matej Lexa (státní příslušnost: SK - Slovenská republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6759890) |
|---|
| Popis výsledku v anglickém jazyce | Algorithms for biological sequence analysis, such as approximate string matching or algorithms for identification of sequence patterns supporting specific structural elements, present good opportunities for hardware acceleration. Implementation of thesealgorithms often results in architectures based on multidimensional arrays of computing elements. Mapping effectively these computational structures on FPGAs remains one of the challenging problems. This paper focuses on a specific hardware architecturefor detection of approximate tandem repeats in sequences. We show how to create a parametrized architecture model combined with an automatic technique that can determine appropriate circuit dimensions with respect to input task parameters and the targetplatform properties. |
|---|
| Klíčová slova oddělená středníkem | Approximate tandem repeat; Architecture model; Automated mapping; FPGA |
|---|
| Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
|---|
| DOI výsledku | 10.1109/FCCM.2010.21 |
|---|