| Údaje o výsledku |
| Identifikační kód | RIV/00216224:14330/11:00050002 |
| Název v původním jazyce | Architecture Model for Approximate Tandem Repeat Detection |
| Druh | D - Článek ve sborníku |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor | IN - Informatika |
| Rok uplatnění | 2011 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů |
| Počet výskytů výsledku | 3 |
| Údaje z Hodnocení výsledků výzkumných organizací 2014 |
| Výsledek byl hodnocen v Pilíři I |
| Rozsah vyřazení výsledku | Tento výskyt výsledku není vyřazen |
| Zařazení výsledku v hodnocení | D - Článek ve sborníku |
| Skupina oboru v hodnocení | 04 - Technické a informatické vědy |
| Konkrétní způsob(y) hodnocení výsledku | Výsledek hodnocený již v předchozím hodnocení, body se přebírají |
| Bodové ohodnocení | 8,000 |
| Faktor korekce | 100,9 % |
| Body (upravené podle přílohy č. 8 Metodiky) | 8,074 |
| Rozdělení výsledku mezi předkladatele |
| Organizace | Výzkumná organizace? | Podíl | Body | Body (upravené podle přílohy č. 8 Metodiky) |
|---|
| Masarykova univerzita / Fakulta informatiky | ano | 50,0 % | 4,000 | 4,037 |
| Vysoké učení technické v Brně / Fakulta informačních technologií | ano | 50,0 % | 4,000 | 4,037 |
|
| Tvůrci výsledku |
| Počet tvůrců celkem | 2 |
| Počet domácích tvůrců | 1 |
| Tvůrce | Martínek Tomáš (státní příslušnost: CZ - Česká republika; G - garant výsledku; vedidk: 4123484) |
| Tvůrce | Lexa Matej (státní příslušnost: SK - Slovenská republika; A - domácí tvůrce; vedidk: 6759890) |
| Údaje blíže specifikující výsledek |
| Popis v původním jazyce | Algorithms for biological sequence analysis, such as approximate string matching or algorithms for identification of sequence patterns supporting specific structural elements, present good opportunities for hardware acceleration. Implementation of these algorithms often results in architectures based on multidimensional arrays of computing elements. Mapping effectively these computational structures on FPGAs remains one of the challenging problems. This paper focuses on a specific hardware architecture for detection of approximate tandem repeats in sequences. We show how to create a parametrized architecture model combined with an automatic technique that can determine appropriate circuit dimensions with respect to input task parameters and the target platform properties. |
| Klíčová slova | Approximate tandem repeat; Architecture model; Automated mapping; FPGA |
| Název sborníku | 22nd IEEE International Conference on Application-specific Systems, Architectures and Processors |
| Rozsah stran | 239-242 |
| ISBN | 978-1-4577-1290-6 |
| Počet stran výsledku | 4 |
| Název nakladatele | IEEE CS |
| Místo vydání | Santa Monica, California, US |
| Místo konání akce | Santa Monica, California, US |
| Rok konání akce | 2011 |
| Typ akce podle státní příslušnoti účastníků | WRD - Světová |
| DOI výsledku | 10.1109/FCCM.2010.21 |
| Údaje o tomto záznamu o výsledku |
| Předkladatel | Masarykova univerzita / Fakulta informatiky |
| Dodavatel | GA0 - Grantová agentura České republiky (GA ČR) |
| Rok sběru | 2012 |
| Systémové označení dodávky dat | RIV12-GA0-14330___/02:1 |
| Specifikace | RIV/00216224:14330/11:00050002!RIV12-GA0-14330___ |
| Kontrolní kód | [55BEAD75596F] |
| Další výskyty tohoto výsledku od jiných předkladatelů |
| Další předkladatel | Vysoké učení technické v Brně / Fakulta informačních technologií |
| Dodáno GA ČR v roce 2013 | Záznam s identifikačním kódem RIV/00216305:26230/11:PU96097 v dodávce dat RIV13-GA0-26230___/02:2 |
| Dodáno MŠMT v roce 2012 | Záznam s identifikačním kódem RIV/00216305:26230/11:PU96097 v dodávce dat RIV12-MSM-26230___/02:2 |
| Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl |
| Projekt | GA204/08/1560 - Bioinformatická a experimentální identifikace nekanonických struktur v genomové DNA (2008-2010, GA0/GA) |
| Výzkumný záměr | MSM0021630528 - Výzkum informačních technologií z hlediska bezpečnosti (2007-2013, MSM) |
| S - Specifický výzkum na vysokých školách |