Impaktované časopisy          Konference          Celkem

Podklady pro hodnocení kateder na základě článků v impaktovaných časopisech ohodnocených podle pozice časopisu v oborovém žebříčku dle JCR, konferenčních příspěvků ohodnocených dle interních pravidel a „RIV“ bodů posledního Hodnocení 2016. Jde o výsledky vykázané za FI nebo s deklarovaným podílem FI (konkrétní výše podílu není nijak zohledněna).

Hodnoty výsledků dělím rovným dílem mezi domácí autory s vazbou k jedné z kateder. Základem pro rozřazení autorů ke katedrám je seznam zaměstnanců kateder. Doktorandi jsou řazeni na katedru svého školitele, ze zbylých domácích autorů jsou ti, kteří mají spoluautory pouze z jedné katedry, zařazeni na tuto katedru, z ostatních jsou ti s významnějším přínosem zařazeni ručně (např. magisterští studenti dle vedoucího DP), podíl těch s marginálním přínosem je rozdělen mezi jejich spoluautory.

Lexa Matej (IS), katedra: KSUZD, zdroj vazby: seznam

Články v impaktovaných časopisech dle IS MU 2014–2018 (celkem 4.316)

Hodnota se počítá jako (Nmax - N + 1) / N, kde Nmax je počet časopisů v kategorii a N pořadí časopisu dle IF. Při zařazení časopisu do více kategorií nebo shodě IF se bere průměr. Najetím myší na hodnotu se zobrazí pořadí v oborových žebříčcích daného ročníku JCR (pro 2018 JCR2017; JCR2018 ještě nevyšlo), odkaz vede na stránku časopisu v JCR (oborové žebříčky tam jsou pod odkazem Rank), funguje ale jen z IP adres MU a je potřeba kliknout alespoň dvakrát, první přístup pouze inicializuje session.

hodnotadíl autoraroktitlezapočítaníostatní
0.960.962016Hammock: a hidden Markov model-based peptide clustering algorithm to identify protein-interaction consensus motifs in large datasets (DOI)LexaKrejčí, Hupp, Vojtěšek, Müller
0.9340.9342017pqsfinder: an exhaustive and imperfection-tolerant search tool for potential quadruplex-forming sequences in R (DOI)LexaHon, Martínek, Zendulka
0.810.4052014Guanine quadruplexes are formed by specific regions of human transposable elements (DOI)Lexa, VorlíčkováSteflova, Martínek, Vyskot, Kejnovský
0.7810.7812016p53 Specifically Binds Triplex DNA In Vitro and in Cells (DOI)LexaBrázdová, Tichý, Helma, Bažantová, Polášková, Krejčí, Petr, Navrátilová, Tichá, Nejedlý, Bennink, Subramaniam, Bábková, Martínek, Adámik
0.7270.7272018Quadruplex DNA in long terminal repeats in maize LTR retrotransposons inhibits the expression of a reporter gene in yeast (DOI)LexaTokan, Puterová, Kejnovský
0.5090.5092015Transposable elements and G-quadruplexes (DOI)LexaKejnovský, Tokan

Články ve sbornících dle IS MU 2014–2018 (celkem C: 1, D: 2) Popis rankingu viz zde.
rankroktitlezapočítaníostatnínakladatelsborník
C
ICCABS
2016Semi-automatic mining of correlated data from a complex database: Correlation network visualization (DOI)Lexa, LapárIEEEComputational Advances in Bio and Medical Sciences (ICCABS), 2016 IEEE 6th International Conference on
C
IWBBIO
2015A flexible denormalization technique for data analysis above a deeply-structured relational database: biomedical applications (DOI)Štefanič, LexaSpringer International PublishingLecture Notes in Computer Science 9043, Bioinformatics and Biomedical Engineering, Third International Conference, IWBBIO 2015, Granada, Spain, April 15-17 2015, Proceedings, Part I
D
Bioinformatics
2014The possibilities of using biological knowledge for filtering pairs of SNPs in GWAS studies: an exploratory study on public protein-interaction and pathway data. (DOI)Lexa, ŠtefaničSciTePressProceedings of the International Conference on Bioinformatics Models, Methods and Algorithms
D
Bioinformatics
2014Uneven distribution of potential triplex sequences in the human genome. In silico study using the R/Bioconductor package triplex. (DOI)LexaMartínek, BrázdováSciTePressProceedings of the International Conference on Bioinformatics Models, Methods and Algorithms
D
Bioinformatics
2014The Possibilities of Filtering Pairs of SNPs in GWAS Studies Exploratory Study on Public Protein-interaction and Pathway DataLexa, ŠtefaničSCITEPRESSBIOINFORMATICS 2014: PROCEEDINGS OF THE INTERNATIONAL CONFERENCE ON BIOINFORMATICS MODELS, METHODS AND ALGORITHMS

Body v RIVu dle Hodnocení 2016 (tedy 2011–2015; celkem 104.112)

Z Hodnocení jsou převzaty body za publikační výsledky z Pilíře I, body za aplikované výsledky (SW, druh R) z roku 2011 z Pilíře III a body za projekty aplikovaného výzkumu z Pilíře III, které jsou vždy přiděleny vedoucím těchto projektů (p.t. Horák, Matyáš, Pala, Přenosil a Zezula, z pohledu dělení na katedry postačující, z individuálního pohledu to pochopitelně čísla trochu zkresluje). Případné procentní podíly pracovišť v IS MU nejsou zohledněny (stran přerozdělení mezi fakultami jde o malé desítky bodů, ale bylo by obtížné to korektně dohledat, stran rozdělení mezi katedry jsou data neúplná a/nebo nespolehlivá). Pozor: je třeba mít na paměti, že časové „okno“ Hodnocení je o tři roky starší (2011–15) oproti pětiletce započítaných článků (2014–18); novější data tohoto druhu už nebudou, zatím se podle toho ovšem v podstatě stále dělí >97 % peněz mezi VŠ, tak je na zvážení, nakolik tato data používat.

body FIbody autorarokzařazení :druhtitlezapočítaníostatní
59.70229.8512011Jimp:JA dynamic programming algorithm for identification of triplex-forming sequences (DOI)Lexa, Kopeček
45.26722.6332013Jimp:JTriplex: an R/Bioconductor package for identification and visualization of potential intramolecular triplex patterns in DNA sequences (DOI)Rajdl, Lexa
25.83812.9192015Jimp:JGuanine quadruplexes are formed by specific regions of human transposable elements (DOI)Lexa, Vorlíčková
18.1114.5282013Jimp:JPreferential Binding of Hot Spot Mutant p53 Proteins to Supercoiled DNA In Vitro and in Cells (DOI)Tichý, Lexa, Adámik, Fojta
15.7367.8682015D:DA flexible denormalization technique for data analysis above a deeply-structured relational database: biomedical applications (DOI)Štefanič, Lexa
12.51412.5142015Jimp:JTransposable elements and G-quadruplexes (DOI)Lexa
6.2053.1022012D:DcswHMM: a novel context switching hidden Markov model for biological sequence analysis (DOI)Bystrý, Lexa
4.0374.0372011D:DArchitecture Model for Approximate Tandem Repeat Detection (DOI)Lexa
2.9841.4922014D:DThe Possibilities of Filtering Pairs of SNPs in GWAS Studies Exploratory Study on Public Protein-interaction and Pathway DataLexa, Štefanič
2.9841.4922014D:DThe possibilities of using biological knowledge for filtering pairs of SNPs in GWAS studies: an exploratory study on public protein-interaction and pathway data. (DOI)Lexa, Štefanič
2.4822.4822012D:DPrediction of significant cruciform structures from sequence in topologically constrained DNA - a probabilistic modelling approach (DOI)Lexa
1.1941.1942014D:DUneven distribution of potential triplex sequences in the human genome. In silico study using the R/Bioconductor package triplex. (DOI)Lexa
002013neu:DGenerovanie simulovaných testovacích dát pre genómové asociačné štúdieŠtefanič, Lexa
002013neu:DIn silico search for secondary structures in p53 target genes using R/BioconductorLexa