| Údaje o výsledku |
| Identifikační kód | RIV/00216305:26230/13:PU106432 |
| Název v původním jazyce | In silico search for secondary structures in p53 target genes using R/Bioconductor |
| Druh | D - Článek ve sborníku |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor | IN - Informatika |
| Rok uplatnění | 2013 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů |
| Počet výskytů výsledku | 2 |
| Údaje z Hodnocení výsledků výzkumných organizací 2014 |
| Výsledek byl hodnocen v Pilíři I |
| Rozsah vyřazení výsledku | Tento výskyt výsledku není vyřazen |
| Zařazení výsledku v hodnocení | neu - Výsledky bez bodového hodnocení nebo vyřazené |
| Skupina oboru v hodnocení | 04 - Technické a informatické vědy |
| Konkrétní způsob(y) hodnocení výsledku | Článek ve sborníku má uvedeno ISBN nebo ISSN, ale to není v databázi Conference Proceedings Citation Index ani v databázi Scopus. |
| Rozdělení výsledku mezi předkladatele |
| Organizace | Výzkumná organizace? | Podíl | Body | Body (upravené podle přílohy č. 8 Metodiky) |
|---|
| Masarykova univerzita / Fakulta informatiky | ano | 40,0 % | 0,000 | |
| Vysoké učení technické v Brně / Fakulta informačních technologií | ano | 40,0 % | 0,000 | |
|
| Tvůrci výsledku |
| Počet tvůrců celkem | 3 |
| Počet domácích tvůrců | 1 |
| Tvůrce | Brázdová Marie (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Tvůrce | Martínek Tomáš (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce; vedidk: 4123484) |
| Tvůrce | Lexa Matej (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Údaje blíže specifikující výsledek |
| Popis v původním jazyce | p53 is a well-known transcription factor and tumor suppressor, regulating among other processes, the commitment of cells to apoptosis and DNA repair. p53 mutants are often found in cancers of different kinds, either as mutant or misregulated p53. p53 is involved in many other processes and we currently do not understand the full range of its functions. It is known to recognize the p53con sequence by its specific DNA-binding domain (DBD). It is also known to bind DNA non-specifically. This binding has been shown to involve superhelical DNA, more specifically, cruciform, triplex and quadruplex structures. In our laboratories we were intrigued by the possible interplay between non-canonical DNA structure binding and regular p53con binding. In an attempt to clarify this interplay and discover suitable candidate genes for further study, we carried out an in silico study on the human genome. We identified all the occurences of potential cruciform DNA, triplex DNA, quadruplex DNA and p53con recog |
| Klíčová slova | R/bioconductor, p53, bioinformatics, DNA sequence analysis |
| Název sborníku | ITAT 2013: Information Technologies - Applications and Theory |
| Rozsah stran | 42-46 |
| Forma vydání | P - Tištěná verze „print“ |
| ISBN | 978-1-4909-5208-6 |
| Počet stran výsledku | 5 |
| Název nakladatele | CreativeSpace Independent Publishing Platform |
| Místo vydání | Donovaly |
| Místo konání akce | Hotel Zornička, Donovaly |
| Datum zahájení akce | 11.9.2013 |
| Typ akce podle státní příslušnoti účastníků | EUR - Evropská |
| Údaje o tomto záznamu o výsledku |
| Předkladatel | Vysoké učení technické v Brně / Fakulta informačních technologií |
| Dodavatel | MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Rok sběru | 2014 |
| Systémové označení dodávky dat | RIV14-MSM-26230___/01:1 |
| Specifikace | RIV/00216305:26230/13:PU106432!RIV14-MSM-26230___ |
| Kontrolní kód | [E602DE1AFA30] |
| Další výskyty tohoto výsledku od jiných předkladatelů |
| Další předkladatel | Masarykova univerzita / Fakulta informatiky |
| Dodáno MŠMT v roce 2014 | Záznam s identifikačním kódem RIV/00216224:14330/13:00068953 v dodávce dat RIV14-MSM-14330___/01:1 |
| Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl |
| Projekt | ED1.1.00/02.0070 - Centrum excelence IT4Innovations (2011-2015, MSM/ED) |
| Projekt | LG13010 - Zastoupení ČR v European Research Consortium for Informatics and Mathematics (2013-2015, MSM/LG) |
| Výzkumný záměr | MSM0021630528 - Výzkum informačních technologií z hlediska bezpečnosti (2007-2013, MSM) |
| S - Specifický výzkum na vysokých školách |