| Údaje o výsledku |
| Identifikační kód | RIV/00216224:14330/13:00066457 |
| Název v původním jazyce | Real-time Visualization and Exploration of Protein Empty Space with Varying Parameters |
| Druh | J - Článek v odborném periodiku |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor | IN - Informatika |
| Rok uplatnění | 2013 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů |
| Počet výskytů výsledku | 2 |
| Údaje z Hodnocení výsledků výzkumných organizací 2014 |
| Výsledek byl hodnocen v Pilíři I |
| Rozsah vyřazení výsledku | Tento výskyt výsledku není vyřazen |
| Zařazení výsledku v hodnocení | Jsc - Článek v časopise evidovaném v databázi Scopus, který není evidován ve Web of Science |
| Skupina oboru v hodnocení | 04 - Technické a informatické vědy |
| Konkrétní způsob(y) hodnocení výsledku | Článek nalezený ve Scopus s typem Article, Review nebo Letter |
| Bodové ohodnocení | 10,000 |
| Faktor korekce | 86,1 % |
| Body (upravené podle přílohy č. 8 Metodiky) | 8,612 |
| Rozdělení výsledku mezi předkladatele |
| Organizace | Výzkumná organizace? | Podíl | Body | Body (upravené podle přílohy č. 8 Metodiky) |
|---|
| Masarykova univerzita / Fakulta informatiky | ano | 100,0 % | 10,000 | 8,612 |
|
| Tvůrci výsledku |
| Počet tvůrců celkem | 4 |
| Počet domácích tvůrců | 4 |
| Tvůrce | Strnad Ondřej (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce; vedidk: 6875017) |
| Tvůrce | Kozlíková Barbora (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce; vedidk: 5901332) |
| Tvůrce | Šustr Vilém (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce; vedidk: 6902677) |
| Tvůrce | Sochor Jiří (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce; vedidk: 7676239) |
| Údaje blíže specifikující výsledek |
| Popis v původním jazyce | Long-term research in the area of protein analysis proved the importance of an empty space situated inside these macromolecular structures. This empty space influences the protein function, characteristics or reactivity. Many algorithms enabling computation of these empty spaces (or voids) have been published and their results were evaluated by protein engineers to confirm their chemical relevance. However, not all detected voids inside protein are of the same importance. Thus, the examination and assessment of all voids must follow to reveal the important ones. In this phase the visual representation of voids is very valuable and substantially decreases the time spent in this evaluation phase. In this paper we present an extension of the algorithm for the visualization and further evaluation of protein voids in real-time. The user-driven approach enables to compute and display empty space that satisfies the input parameters instantly. |
| Klíčová slova | protein; empty space; void; visualization; real-time; cavity; volume; Voronoi diagram; Delaunay triangulation |
| Název periodka | International Journal on Advances in Life Sciences |
| Rozsah stran | 160-170 |
| ISSN | 1942-2660 |
| Svazek periodika | year 2013 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | vol. 5, no. 3 & 4 |
| Stát vydavatele periodika | NL - Nizozemsko |
| Počet stran výsledku | 11 |
| Údaje o tomto záznamu o výsledku |
| Předkladatel | Masarykova univerzita / Fakulta informatiky |
| Dodavatel | GA0 - Grantová agentura České republiky (GA ČR) |
| Rok sběru | 2014 |
| Systémové označení dodávky dat | RIV14-GA0-14330___/01:1 |
| Specifikace | RIV/00216224:14330/13:00066457!RIV14-GA0-14330___ |
| Kontrolní kód | [FECDFC9B4AEA] |
| Další výskyty tohoto výsledku od stejného předkladatele |
| Dodáno MŠMT v roce 2014 | Záznam s identifikačním kódem RIV/00216224:14330/13:00066457 v dodávce dat RIV14-MSM-14330___/01:1 |
| Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl |
| Projekt | GAP202/10/1435 - Analýza a vizualizace proteinových struktur (2010-2012, GA0/GA) |
| Projekt | LG13010 - Zastoupení ČR v European Research Consortium for Informatics and Mathematics (2013-2015, MSM/LG) |