RIV/00216224:14330/13:00066280 - Exploring Parameter Space of Stochastic Biochemical Systems Using Quantitative Model Checking (2013)

Údaje o výsledku
Identifikační kódRIV/00216224:14330/13:00066280
Název v původním jazyceExploring Parameter Space of Stochastic Biochemical Systems Using Quantitative Model Checking
DruhD - Článek ve sborníku
Jazykeng - angličtina
OborIN - Informatika
Rok uplatnění2013
Kód důvěrnosti údajůS - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
Počet výskytů výsledku2
Údaje z Hodnocení výsledků výzkumných organizací 2014
Výsledek byl hodnocen v Pilíři I
Rozsah vyřazení výsledkuTento výskyt výsledku není vyřazen
Zařazení výsledku v hodnoceníD - Článek ve sborníku
Skupina oboru v hodnocení04 - Technické a informatické vědy
Konkrétní způsob(y) hodnocení výsledkuČlánek ve sborníku evidovaném v databázi Scopus bodovaný podle SJR zdroje typu Book Series nebo Conference Proceedings
Bodové ohodnocení46,181
Faktor korekce50,1 %
Body (upravené podle přílohy č. 8 Metodiky)23,141
Rozdělení výsledku mezi předkladatele
OrganizaceVýzkumná organizace?PodílBodyBody (upravené podle přílohy č. 8 Metodiky)
Masarykova univerzita / Fakulta informatikyano100,0 %46,18123,141
Tvůrci výsledku
Počet tvůrců celkem4
Počet domácích tvůrců4
TvůrceBrim Luboš (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce; vedidk: 6500773)
TvůrceČeška Milan (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce; vedidk: 1846000)
TvůrceDražan Sven (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce; vedidk: 3111342)
TvůrceŠafránek David (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce; vedidk: 8225400)
Údaje blíže specifikující výsledek
Popis v původním jazyceWe propose an automated method for exploring kinetic parameters of stochastic biochemical systems. The main question addressed is how the validity of an a priori given hypothesis expressed as a temporal logic property depends on kinetic parameters. Our aim is to compute a landscape function that, for each parameter point from the inspected parameter space, returns the quantitative model checking result for the respective continuous time Markov chain. Since the parameter space is in principle dense, it is infeasible to compute the landscape function directly. Hence, we design an effective method that iteratively approximates the lower and upper bounds of the landscape function with respect to a given accuracy. To this end, we modify the standard uniformization technique and introduce an iterative parameter space decomposition. We also demonstrate our approach on two biologically motivated case studies.
Klíčová slovacontinuous-time Markov chains; parameter exploration; model checking
Název sborníku25th International Conference, CAV 2013, Saint Petersburg, Russia, July 13-19, 2013. Proceedings
Rozsah stran107-123
Forma vydáníP - Tištěná verze „print“
ISSN0302-9743
ISBN9783642397981
Počet stran výsledku17
Název nakladateleSpringer-Verlag. (Berlin; Heidelberg)
Místo vydáníBerlin
Místo konání akceSaint Petersburg
Rok konání akce2013
Typ akce podle státní příslušnoti účastníkůWRD - Světová
DOI výsledku10.1007/978-3-642-39799-8_7
Údaje o tomto záznamu o výsledku
PředkladatelMasarykova univerzita / Fakulta informatiky
DodavatelGA0 - Grantová agentura České republiky (GA ČR)
Rok sběru2014
Systémové označení dodávky datRIV14-GA0-14330___/01:1
SpecifikaceRIV/00216224:14330/13:00066280!RIV14-GA0-14330___
Kontrolní kód[187948D595FA]
Další výskyty tohoto výsledku od stejného předkladatele
Dodáno MŠMT v roce 2014Záznam s identifikačním kódem RIV/00216224:14330/13:00066280 v dodávce dat RIV14-MSM-14330___/01:1
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
ProjektEE2.3.20.0256 - Vytvoření výzkumného týmu a mezinárodního konzorcia pro počítačový model buňky sinice (2012-2015, MSM/EE)
ProjektEE2.3.30.0009 - Zaměstnáním čerstvých absolventů doktorského studia k vědecké excelenci (2012-2015, MSM/EE)
ProjektGAP202/11/0312 - Vývoj a verifikace softwarových komponent v zapouzdřených systémech (2011-2013, GA0/GA)
S - Specifický výzkum na vysokých školách