| Údaje o výsledku |
| Identifikační kód | RIV/00216224:14330/13:00065959 |
| Název v původním jazyce | Real-time visualization of protein empty space with varying parameters |
| Druh | D - Článek ve sborníku |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor | IN - Informatika |
| Rok uplatnění | 2013 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů |
| Počet výskytů výsledku | 2 |
| Údaje z Hodnocení výsledků výzkumných organizací 2014 |
| Výsledek byl hodnocen v Pilíři I |
| Rozsah vyřazení výsledku | Tento výskyt výsledku není vyřazen |
| Zařazení výsledku v hodnocení | neu - Výsledky bez bodového hodnocení nebo vyřazené |
| Skupina oboru v hodnocení | 04 - Technické a informatické vědy |
| Konkrétní způsob(y) hodnocení výsledku | Článek ve sborníku má uvedeno ISBN nebo ISSN, ale to není v databázi Conference Proceedings Citation Index ani v databázi Scopus. |
| Rozdělení výsledku mezi předkladatele |
| Organizace | Výzkumná organizace? | Podíl | Body | Body (upravené podle přílohy č. 8 Metodiky) |
|---|
| Masarykova univerzita / Fakulta informatiky | ano | 100,0 % | 0,000 | |
|
| Tvůrci výsledku |
| Počet tvůrců celkem | 4 |
| Počet domácích tvůrců | 4 |
| Tvůrce | Strnad Ondřej (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce; vedidk: 6875017) |
| Tvůrce | Šustr Vilém (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce; vedidk: 6902677) |
| Tvůrce | Kozlíková Barbora (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce; vedidk: 5901332) |
| Tvůrce | Sochor Jiří (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce; vedidk: 7676239) |
| Údaje blíže specifikující výsledek |
| Popis v původním jazyce | Exploration of empty space inside protein structures is playing a crucial role in protein engineering and drug design. Such empty space inside protein can be utilized for design of protein mutations. The importance of empty space is also based on its ability to accept a small ligand molecule which can react with the protein. The product of such reaction can form a basis of new medications. Many algorithms enabling computation of these empty spaces, often marked as voids, have been published and their results were evaluated by protein engineers to confirm their chemical relevance. However, not each void of the protein can be considered as a target point of ligand binding. Thus the following examination and assessment of all voids has to be performed. In this phase the visual representation of voids is very valuable and substantially decreases time of this evaluation phase. In this paper, we introduce a novel algorithm for visualization and further evaluation of voids in real-time. |
| Klíčová slova | protein; empty space; void; visualization; real-time; cavity |
| Rozsah stran | 65-70 |
| Název sborníku | Proceedings of Biotechno |
| Forma vydání | E - Elektronická verze „online“ |
| ISBN | 9781612082608 |
| Počet stran výsledku | 6 |
| Název nakladatele | IARIA XPS Press |
| Místo vydání | Lisbon/Portugal |
| Místo konání akce | Lisbon, Portugal |
| Datum zahájení akce | 22.3.2013 |
| Typ akce podle státní příslušnoti účastníků | WRD - Světová |
| Údaje o tomto záznamu o výsledku |
| Předkladatel | Masarykova univerzita / Fakulta informatiky |
| Dodavatel | GA0 - Grantová agentura České republiky (GA ČR) |
| Rok sběru | 2014 |
| Systémové označení dodávky dat | RIV14-GA0-14330___/01:1 |
| Specifikace | RIV/00216224:14330/13:00065959!RIV14-GA0-14330___ |
| Kontrolní kód | [77C994A62432] |
| Další výskyty tohoto výsledku od stejného předkladatele |
| Dodáno MŠMT v roce 2014 | Záznam s identifikačním kódem RIV/00216224:14330/13:00065959 v dodávce dat RIV14-MSM-14330___/01:1 |
| Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl |
| Projekt | GAP202/10/1435 - Analýza a vizualizace proteinových struktur (2010-2012, GA0/GA) |
| Projekt | LG13010 - Zastoupení ČR v European Research Consortium for Informatics and Mathematics (2013-2015, MSM/LG) |
| S - Specifický výzkum na vysokých školách |