| Údaje o výsledku |
| Identifikační kód | RIV/00216224:14330/13:00065956 |
| Název v původním jazyce | Timed Modelling of Gene Networks with Arbitrary Expression Level Discretization |
| Druh | D - Článek ve sborníku |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor | IN - Informatika |
| Rok uplatnění | 2013 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů |
| Počet výskytů výsledku | 2 |
| Údaje z Hodnocení výsledků výzkumných organizací 2014 |
| Výsledek byl hodnocen v Pilíři I |
| Rozsah vyřazení výsledku | Tento výskyt výsledku není vyřazen |
| Zařazení výsledku v hodnocení | D - Článek ve sborníku |
| Skupina oboru v hodnocení | 04 - Technické a informatické vědy |
| Konkrétní způsob(y) hodnocení výsledku | Článek ve sborníku evidovaném v databázi Scopus |
| Bodové ohodnocení | 8,000 |
| Faktor korekce | 50,1 % |
| Body (upravené podle přílohy č. 8 Metodiky) | 4,009 |
| Rozdělení výsledku mezi předkladatele |
| Organizace | Výzkumná organizace? | Podíl | Body | Body (upravené podle přílohy č. 8 Metodiky) |
|---|
| Masarykova univerzita / Fakulta informatiky | ano | 66,7 % | 5,333 | 2,672 |
|
| Tvůrci výsledku |
| Počet tvůrců celkem | 4 |
| Počet domácích tvůrců | 2 |
| Tvůrce | Van Goethem Simon (státní příslušnost: BE - Belgické království) |
| Tvůrce | Jacquet Jean-Marie (státní příslušnost: BE - Belgické království) |
| Tvůrce | Brim Luboš (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce; vedidk: 6500773) |
| Tvůrce | Šafránek David (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce; vedidk: 8225400) |
| Údaje blíže specifikující výsledek |
| Popis v původním jazyce | In this paper, a novel approach to discrete modeling of gene regulatory networks is presented. The approach is based on timed automata and is new in: (i) reflecting discrete abstraction of gene expression with arbitrary granularity, (ii) combining boolean logic with approximation of Hill kinetics. This is achieved by introducing delays that change dynamically with respect to current activity levels of regulating genes. The approach is implemented in UPPAAL and evaluated on benchmark models and on a biological case study. |
| Klíčová slova | timed automata; gene regulatory networks; UPPAAL |
| Rozsah stran | 67-81 |
| Název sborníku | Proceedings of the Third International Workshop on Interactions Between Computer Science and Biology (CS2Bio'12) |
| Forma vydání | E - Elektronická verze „online“ |
| ISSN | 1571-0661 |
| Počet stran výsledku | 15 |
| Název nakladatele | Elsevier |
| Místo vydání | Neuveden |
| Místo konání akce | Florencie |
| Rok konání akce | 2012 |
| Typ akce podle státní příslušnoti účastníků | WRD - Světová |
| Adresa www stránky s výsledkem | http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1571066113000212 |
| DOI výsledku | 10.1016/j.entcs.2013.02.019 |
| Údaje o tomto záznamu o výsledku |
| Předkladatel | Masarykova univerzita / Fakulta informatiky |
| Dodavatel | MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Rok sběru | 2014 |
| Systémové označení dodávky dat | RIV14-MSM-14330___/01:1 |
| Specifikace | RIV/00216224:14330/13:00065956!RIV14-MSM-14330___ |
| Kontrolní kód | [FD057ACD7258] |
| Další výskyty tohoto výsledku od stejného předkladatele |
| Dodáno GA ČR v roce 2014 | Záznam s identifikačním kódem RIV/00216224:14330/13:00065956 v dodávce dat RIV14-GA0-14330___/01:1 |
| Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl |
| Projekt | GAP202/11/0312 - Vývoj a verifikace softwarových komponent v zapouzdřených systémech (2011-2013, GA0/GA) |
| S - Specifický výzkum na vysokých školách |