| Údaje o výsledku |
| Identifikační kód | RIV/00216224:14330/12:00059376 |
| Název v původním jazyce | cswHMM: a novel context switching hidden Markov model for biological sequence analysis |
| Druh | D - Článek ve sborníku |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor | IN - Informatika |
| Rok uplatnění | 2012 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů |
| Počet výskytů výsledku | 1 |
| Údaje z Hodnocení výsledků výzkumných organizací 2014 |
| Výsledek byl hodnocen v Pilíři I |
| Rozsah vyřazení výsledku | Tento výskyt výsledku není vyřazen |
| Zařazení výsledku v hodnocení | D - Článek ve sborníku |
| Skupina oboru v hodnocení | 04 - Technické a informatické vědy |
| Konkrétní způsob(y) hodnocení výsledku | Výsledek hodnocený již v předchozím hodnocení, body se přebírají |
| Bodové ohodnocení | 8,000 |
| Faktor korekce | 77,6 % |
| Body (upravené podle přílohy č. 8 Metodiky) | 6,205 |
| Rozdělení výsledku mezi předkladatele |
| Organizace | Výzkumná organizace? | Podíl | Body | Body (upravené podle přílohy č. 8 Metodiky) |
|---|
| Masarykova univerzita / Fakulta informatiky | ano | 100,0 % | 8,000 | 6,205 |
|
| Tvůrci výsledku |
| Počet tvůrců celkem | 2 |
| Počet domácích tvůrců | 2 |
| Tvůrce | Bystrý Vojtěch (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce; G - garant výsledku; vedidk: 1984861) |
| Tvůrce | Lexa Matej (státní příslušnost: SK - Slovenská republika; A - domácí tvůrce; vedidk: 6759890) |
| Údaje blíže specifikující výsledek |
| Popis v původním jazyce | In this work we created a sequence model that goes beyond simple linear patterns to model a specific type of higher-order relationship possible in biological sequences. Particularly, we seek models that can account for partially overlaid and interleaved patterns in biological sequences. Our proposed context-switching model (cswHMM) is designed as a variable-order hidden Markov model (HMM) with a specific structure that allows switching control between two or more sub-models.Tests of this approach suggest that a combination of HMMs for protein sequence analysis, such as pattern mining based HMMs or profile HMMs, with the context-switching approach can improve the descriptive ability and performance of the models. |
| Klíčová slova | bioinformatics; data-mining; hidden Markov models |
| Rozsah stran | 208-213 |
| Název sborníku | Proceedings of the International Conference on Bioinformatics Models, Methods and Algorithms. |
| Forma vydání | P - Tištěná verze „print“ |
| Počet stran výsledku | 6 |
| ISBN | 9789898425904 |
| Název nakladatele | SciTePress |
| Místo vydání | Neuveden |
| Místo konání akce | Algarve, Portugal |
| Datum zahájení akce | 1.2.2012 |
| Typ akce podle státní příslušnoti účastníků | WRD - Světová |
| DOI výsledku | 10.5220/0003780902080213 |
| Údaje o tomto záznamu o výsledku |
| Předkladatel | Masarykova univerzita / Fakulta informatiky |
| Dodavatel | MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Rok sběru | 2013 |
| Systémové označení dodávky dat | RIV13-MSM-14330___/02:2 |
| Specifikace | RIV/00216224:14330/12:00059376!RIV13-MSM-14330___ |
| Kontrolní kód | [ACB6175D4D7A] |
| Jiný výskyt tohoto výsledku se v RIV nenachází |
| Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl |
| Projekt | LA09016 - Účast ČR v European Research Consortium for Informatics and Mathematics (ERCIM) (2009-2012, MSM/LA) |
| S - Specifický výzkum na vysokých školách |