| Údaje o výsledku |
| Identifikační kód | RIV/00216224:14330/12:00057781 |
| Název v původním jazyce | Parameter Identification and Model Ranking of Thomas Networks |
| Druh | D - Článek ve sborníku |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor | IN - Informatika |
| Rok uplatnění | 2012 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů |
| Počet výskytů výsledku | 2 |
| Údaje z Hodnocení výsledků výzkumných organizací 2014 |
| Výsledek byl hodnocen v Pilíři I |
| Rozsah vyřazení výsledku | Tento výskyt výsledku není vyřazen |
| Zařazení výsledku v hodnocení | D - Článek ve sborníku |
| Skupina oboru v hodnocení | 04 - Technické a informatické vědy |
| Konkrétní způsob(y) hodnocení výsledku | Výsledek hodnocený již v předchozím hodnocení, body se přebírají |
| Bodové ohodnocení | 44,376 |
| Faktor korekce | 77,6 % |
| Body (upravené podle přílohy č. 8 Metodiky) | 34,420 |
| Rozdělení výsledku mezi předkladatele |
| Organizace | Výzkumná organizace? | Podíl | Body | Body (upravené podle přílohy č. 8 Metodiky) |
|---|
| Masarykova univerzita / Fakulta informatiky | ano | 75,0 % | 33,282 | 25,815 |
|
| Tvůrci výsledku |
| Počet tvůrců celkem | 5 |
| Počet domácích tvůrců | 3 |
| Tvůrce | Klarner Hannes (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo) |
| Tvůrce | Streck Adam (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce; vedidk: 6717020) |
| Tvůrce | Šafránek David (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce; G - garant výsledku; vedidk: 8225400) |
| Tvůrce | Kolčák Juraj (státní příslušnost: SK - Slovenská republika; A - domácí tvůrce; vedidk: 1045709) |
| Tvůrce | Siebert Heike (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo) |
| Údaje blíže specifikující výsledek |
| Popis v původním jazyce | We propose a new methodology for identification and analysis of discrete gene networks as defined by René Thomas, supported by a tool chain: (i) given a Thomas network with partially known kinetic parameters, we reduce the number of acceptable parametrizations to those that fit time-series measurements and reflect other known constraints by an improved technique of coloured LTL model checking performing efficiently on Thomas networks in distributed environment; (ii) we introduce classification of acceptable parametrizations to identify most optimal ones; (iii) we propose two ways of visualising parametrizations dynamics wrt time-series data. Finally, computational efficiency is evaluated and the methodology is validated on bacteriophage \lambda case study. |
| Klíčová slova | Thomas network; parameter identification; model checking |
| Název sborníku | Computational Methods in Systems Biology: 10th International Conference, CMSB 2012, London, UK, October 3-5, 2012. Proceedings |
| Rozsah stran | 207-226 |
| Forma vydání | P - Tištěná verze „print“ |
| ISSN | 0302-9743 |
| ISBN | 9783642336355 |
| Počet stran výsledku | 20 |
| Název nakladatele | Springer-Verlag |
| Místo vydání | Berlin |
| Místo konání akce | London |
| Rok konání akce | 2012 |
| Typ akce podle státní příslušnoti účastníků | WRD - Světová |
| Adresa www stránky s výsledkem | http://link.springer.com/chapter/10.1007/978-3-642-33636-2_13 |
| DOI výsledku | 10.1007/978-3-642-33636-2_13 |
| Údaje o tomto záznamu o výsledku |
| Předkladatel | Masarykova univerzita / Fakulta informatiky |
| Dodavatel | MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Rok sběru | 2013 |
| Systémové označení dodávky dat | RIV13-MSM-14330___/02:2 |
| Specifikace | RIV/00216224:14330/12:00057781!RIV13-MSM-14330___ |
| Kontrolní kód | [BAED7560EE5C] |
| Další výskyty tohoto výsledku od stejného předkladatele |
| Dodáno GA ČR v roce 2013 | Záznam s identifikačním kódem RIV/00216224:14330/12:00057781 v dodávce dat RIV13-GA0-14330___/02:2 |
| Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl |
| Projekt | GAP202/11/0312 - Vývoj a verifikace softwarových komponent v zapouzdřených systémech (2011-2013, GA0/GA) |
| S - Specifický výzkum na vysokých školách |