| Údaje o výsledku |
| Identifikační kód | RIV/00216224:14330/11:00049804 |
| Název v původním jazyce | Computation of Dynamic Channels in Proteins |
| Druh | D - Článek ve sborníku |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor | IN - Informatika |
| Rok uplatnění | 2011 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů |
| Počet výskytů výsledku | 2 |
| Údaje z Hodnocení výsledků výzkumných organizací 2014 |
| Výsledek byl hodnocen v Pilíři I |
| Rozsah vyřazení výsledku | Tento výskyt výsledku není vyřazen |
| Zařazení výsledku v hodnocení | neu - Výsledky bez bodového hodnocení nebo vyřazené |
| Skupina oboru v hodnocení | 04 - Technické a informatické vědy |
| Konkrétní způsob(y) hodnocení výsledku | Článek ve sborníku má uvedeno ISBN nebo ISSN, ale to není v databázi Conference Proceedings Citation Index ani v databázi Scopus. |
| Rozdělení výsledku mezi předkladatele |
| Organizace | Výzkumná organizace? | Podíl | Body | Body (upravené podle přílohy č. 8 Metodiky) |
|---|
| Masarykova univerzita / Fakulta informatiky | ano | 100,0 % | 0,000 | |
|
| Tvůrci výsledku |
| Počet tvůrců celkem | 4 |
| Počet domácích tvůrců | 4 |
| Tvůrce | Beneš Petr (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce; G - garant výsledku; vedidk: 5531292) |
| Tvůrce | Medek Petr (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce; vedidk: 1116304) |
| Tvůrce | Strnad Ondřej (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce; vedidk: 6875017) |
| Tvůrce | Sochor Jiří (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce; vedidk: 7676239) |
| Údaje blíže specifikující výsledek |
| Popis v původním jazyce | In this paper, we propose a new method which considers the movement of a protein molecule as a whole for the computation of so called dynamic channels in a molecular dynamics trajectory. The method is based on maximizing the information about the empty space over time and is built on basic computational geometry principles. The dynamic channels highlight pulsing and flexible parts of the molecule. It is believed that such parts allow a ligand to pass into or out from the active site. The method was tested on real protein data and the results indicate that it presents new information about the molecule. |
| Klíčová slova | protein; dynamic channel; molecule; trajectory; computational geometry |
| Rozsah stran | 78-83 |
| Název sborníku | Proceedings of Biotechno |
| Počet stran výsledku | 6 |
| ISBN | 978-1-61208-137-3 |
| Název nakladatele | Neuveden |
| Místo vydání | Venice/Mestre, Italy |
| Místo konání akce | Venice/Mestre, Italy |
| Rok konání akce | 2011 |
| Typ akce podle státní příslušnoti účastníků | WRD - Světová |
| Údaje o tomto záznamu o výsledku |
| Předkladatel | Masarykova univerzita / Fakulta informatiky |
| Dodavatel | MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Rok sběru | 2012 |
| Systémové označení dodávky dat | RIV12-MSM-14330___/01:1 |
| Specifikace | RIV/00216224:14330/11:00049804!RIV12-MSM-14330___ |
| Kontrolní kód | [6BDE5CDE29D7] |
| Další výskyty tohoto výsledku od stejného předkladatele |
| Dodáno GA ČR v roce 2012 | Záznam s identifikačním kódem RIV/00216224:14330/11:00049804 v dodávce dat RIV12-GA0-14330___/02:1 |
| Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl |
| Projekt | GAP202/10/1435 - Analýza a vizualizace proteinových struktur (2010-2012, GA0/GA) |
| Projekt | GA201/09/0097 - Triangularizované modely pro haptiku a virtuální realitu (2009-2011, GA0/GA) |
| Projekt | LC06008 - Centrum počítačové grafiky (2006-2011, MSM/LC) |
| S - Specifický výzkum na vysokých školách |