RIV/00216224:14330/11:00049652 - E-photosynthesis: Web-based platform for modeling of complex photosynthetic processes (2011)

Údaje o výsledku
Identifikační kódRIV/00216224:14330/11:00049652
Název v původním jazyceE-photosynthesis: Web-based platform for modeling of complex photosynthetic processes
DruhJ - Článek v odborném periodiku
Jazykeng - angličtina
OborIN - Informatika
Rok uplatnění2011
Kód důvěrnosti údajůS - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
Počet výskytů výsledku6
Údaje z Hodnocení výsledků výzkumných organizací 2014
Výsledek byl hodnocen v Pilíři I
Rozsah vyřazení výsledkuTento výskyt výsledku není vyřazen
Zařazení výsledku v hodnoceníJimp - Článek v impaktovaném časopise evidovaném ve Web of Science
Skupina oboru v hodnocení08 - Fyzikální vědy
Konkrétní způsob(y) hodnocení výsledkuVýsledek hodnocený již v předchozím hodnocení, body se přebírají
Bodové ohodnocení28,838
Faktor korekce117,4 %
Body (upravené podle přílohy č. 8 Metodiky)33,863
Rozdělení výsledku mezi předkladatele
OrganizaceVýzkumná organizace?PodílBodyBody (upravené podle přílohy č. 8 Metodiky)
Centrum výzkumu globální změny AV ČR, v. v. i.ano28,6 %8,2399,675
Masarykova univerzita / Fakulta informatikyano57,1 %16,47919,350
Univerzita Palackého v Olomouci / Přírodovědecká fakultaano14,3 %4,1204,838
Tvůrci výsledku
Počet tvůrců celkem7
Počet domácích tvůrců4
TvůrceŠafránek David (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce; G - garant výsledku; vedidk: 8225400)
TvůrceČervený Jan (státní příslušnost: CZ - Česká republika)
TvůrceKlement Matej (státní příslušnost: SK - Slovenská republika; A - domácí tvůrce; vedidk: 3054209)
TvůrcePospíšilová Jana (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce; vedidk: 5577470)
TvůrceBrim Luboš (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce; vedidk: 6500773)
TvůrceLazár Dušan (státní příslušnost: CZ - Česká republika)
TvůrceNedbal Ladislav (státní příslušnost: CZ - Česká republika)
Údaje blíže specifikující výsledek
Popis v původním jazyceE-photosynthesis framework is a web-based platform for modeling and analysis of photosynthetic processes. Compared to its earlier version, the present platform employs advanced software methods and technologies to support an effective implementation of vastly diverse kinetic models of photosynthesis. We report on the first phase implementation of the tool new version and demonstrate the functionalities of model visualization, presentation of model components, rate constants, initial conditions and of model annotation. The demonstration also includes export of a model to the Systems Biology Markup Language format and remote numerical simulation of the model.
Klíčová slovaBiomodels repository; Computational models; Photosynthesis; Systems biology; Web platform
Kód UT ISI000287278000002
Název periodkaBioSystems
Rozsah stran115-124
ISSN0303-2647
Svazek periodika103
Číslo periodika v rámci uvedeného svazku2
Stát vydavatele periodikaCZ - Česká republika
Počet stran výsledku10
DOI výsledku10.1016/j.biosystems.2010.10.013
Údaje o tomto záznamu o výsledku
PředkladatelMasarykova univerzita / Fakulta informatiky
DodavatelGA0 - Grantová agentura České republiky (GA ČR)
Rok sběru2012
Systémové označení dodávky datRIV12-GA0-14330___/02:1
SpecifikaceRIV/00216224:14330/11:00049652!RIV12-GA0-14330___
Kontrolní kód[6467F700CAB2]
Další výskyty tohoto výsledku od stejného předkladatele
Dodáno MŠMT v roce 2012Záznam s identifikačním kódem RIV/00216224:14330/11:00049652 v dodávce dat RIV12-MSM-14330___/01:1
Další výskyty tohoto výsledku od jiných předkladatelů
Další předkladatelCentrum výzkumu globální změny AV ČR, v. v. i.
Dodáno AV ČR v roce 2011Záznam s identifikačním kódem RIV/67179843:_____/11:00355674 v dodávce dat RIV11-AV0-67179843/01:1
Dodáno GA ČR v roce 2011Záznam s identifikačním kódem RIV/67179843:_____/11:00355674 v dodávce dat RIV11-GA0-67179843/01:1
Další předkladatelUniverzita Palackého v Olomouci / Přírodovědecká fakulta
Dodáno MŠMT v roce 2011Záznam s identifikačním kódem RIV/61989592:15310/11:10215834 v dodávce dat RIV11-MSM-15310___/01:1
Dodáno MŠMT v roce 2012Záznam s identifikačním kódem RIV/61989592:15310/11:10215834 v dodávce dat RIV12-MSM-15310___/01:1
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
ProjektGA201/09/1389 - Verifikace a analýza velmi velkých počítačových systémů (2009-2011, GA0/GA)
ProjektGA206/09/1284 - Sinice jako buněčná továrna: Modelování a experimentální validace modelů fotosyntetické proměny energie, růstu a produkce cenných látek. (2009-2013, GA0/GA)
Výzkumný záměrAV0Z60870520 - Prostorová a funkční dynamika biologických, ekologických a sociálně-ekonomických systémů v interakci s Globální změnou klimatu (2005-2011, AV0)
Výzkumný záměrMSM0021622419 - Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy (2005-2011, MSM)
Výzkumný záměrMSM6198959215 - Variabilita složek a interakcí v rostlinném patosystému a vliv faktorů prostředí na jejich projev (2005-2011, MSM)
S - Specifický výzkum na vysokých školách