Cvičení -- kvalitativní simulace

Úkol 1 (nebude požadováno v závěrečném testu)

Uvažujme koherentní FFL motiv:

Simulujte dynamiku chování tohoto motivu pomocí nástroje GNA.sim. Regulátor X uvažujte konstantní (typ proměnné "input"), Y a Z jsou variabilní proměnné. Model je dostupný v tomto souboru. Sledujte diskrétní vývoj koncentrací pro následující počáteční podmínky (notace t_x_y odpovida prahove hodnote proteinu X nutne k dosazeni aktivace proteinu Y):

Pro proměnnou Z je zavedena prahová hodnota t_z, důvodem je sledování koncentrace proteinu Z ve dvou diskrétních úrovních (Z < t_z a Z > t_z).