Nástroje

• NetLogo
• Stella, alternativy:
  • Sysdea (v prohlížeči)
  • Insight Maker (volně dostupný, v prohlížeči)
  • Vensim
  • Powersim
  • AnyLogic

Zdroje obecně

Primární učební text je knížka přednášejícího "Modelování a simulace komplexních systémů", která je nyní volně dostupná.

• Komentovaný seznam literatury
• TED.com
• Odkazy uvedené ve slidech.

Konkrétní příklady námětů do "čtenářského deníku"

Z těchto ukázek použijte maximálně 4, další si vyhledejte jiným způsobem.

Úvod, systémové myšlení

• Tragedy of commons. G. Hardin.
• Phil Zimbardo: How people become monsters ... or heroes (TED talk), je vhodné si pro širší kontext dohledat i některou z kritik Zimbarda (např. R. Bregman, Humankind)

Matematické modelování, systémová dynamika

• Introduction to System Thinking. Barry Richmond.
• System Dynamics Methods: A Quick Introduction. Craig Kirkwood.

• Cellular Automata Tutorial. Alexander Schatten.
• Deborah Gordon: Ants (TED talk)
• Bonnie Bassler: How bacteria communicate (TED talk)
• Steven Strogatz: On sync (TED talk)
• Mick Mountz: The hidden world of box-packing (TED talk)

Modelování sítí

• Exploring complex networks. Steven H. Strogatz. Nature 410, 268-276 (2001).
• Statistical mechanics of complex networks. Réka Albert (a další přehledové články o komplexních sítích dostupné zde)

Evoluce, život

• Christoph Adami: Finding life we can't imagine (TED talk)
• Martin Hanczyc: The line between life and not-life (TED talk)

Příklady

• Computational insights into Caenorhabditis elegans vulval development
• Asset Pricing Under Endogenous Expectations in an Artificial Stock

Závěr

• Leverage Points. Donella Meadows.