PB051 Semestralni ukol k hodnoceni - varianta bioinformaticka (30 bodu)

Cilem ukolu bude vytvorit statickou webovou stranku v RMarkdown prezentujici 
vztah regulacnich sekvenci a epigenetickych markeru na vybranem chromosomu
vybraneho genomu.

Postup:

1. Vyhledejte vhodne zdroje dat a ulozte si je do pracovniho adresare.
  - data musi zahrnovat informace o vyskytu nejake funkcni sekvence (napr. vazebni misto transkripcniho faktoru, sekundarni struktura, biologicky vyznamni sekvencni motiv)
  - data musi obsahovat nejakou informaci o stavu chromatinu (otevreny/zavreny mereno DNAzou, transpozazou a podobne, metylace, acetylace DNA nebo histonu, stav chromatinu, 3D data)
2. Vytvorte Rmd dokumenty popisujici a analyzujici rozmisteni sekvenci a markeru na chromosomu
  - nektere znazornete podel chromosomu grafem nebo gradientem barev znazornujici hustotu
  - jine znazornete ukazateli pozic kde se vyskytuji

3. To stejne pro nejaky zajimavy usek chromosomu s vyssim rozlisenim

Odevzdejte:
1. adresar s pracovnimi soubory nebo odkaz na git repozitar
2. adresar s webovymi strankami
3. Bohate dokumentovany kod nebo zvlastni dokument s popisem postupu na cca 1 A4 stranku