Automated Cell Segmentation in Phase-Contrast Images based on Classification and Region Growing (2015)výskyt výsledku
| Identifikační kód | RIV/00216224:14330/15:00082559 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | Automated Cell Segmentation in Phase-Contrast Images based on Classification and Region Growing |
| Druh | D - Článek ve sborníku |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor - skupina | J - Průmysl |
| Obor | JD - Využití počítačů, robotika a její aplikace |
| Rok uplatnění | 2015 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 1 |
| Počet tvůrců celkem | 4 |
| Počet domácích tvůrců | 4 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Roman Stoklasa (státní příslušnost: SK - Slovenská republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3323188) Lukáš Bálek (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 8422176) Pavel Krejčí (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5512646) Petr Matula (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 8544212) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | Cell segmentation in phase-contrast microscopy images remains a challenging problem because of the large variability in subcellular structures and imaging artifacts. In this paper, we present an approach to the automatic segmentation of tightly packed cells in phase-contrast images. We combine the classification of superpixels with the region-growing method to locate cell membrane boundaries. We demonstrate that such a combined approach is able to perform the task of cell detection and segmentation witha high level of precision. On the presented dataset, we achieved 90% precision with 78% recall. The results indicate that this method is suitable for real biological applications. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | phase-contrast microscopy; segmentation; classification; superpixel; cells |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
| DOI výsledku | 10.1109/ISBI.2015.7164149 |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název sborníku | Proceedings of 2015 IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, 2015. |
|---|---|
| ISBN | 9781479923748 |
| ISSN | 1945-7928 |
| Počet stran výsledku | 5 |
| Strana od-do | 1447-1451 |
| Název nakladatele | Engineering in Medicine and Biology Society |
| Místo vydání | Neuveden |
| Místo konání akce | Brooklyn, NY |
| Datum konání akce | 16.04.2015 |
| Typ akce podle státní příslušnosti účastníků | WRD - Celosvětová |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Masarykova univerzita / Fakulta informatiky |
|---|---|
| Dodavatel | MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Rok sběru | 2016 |
| Specifikace | RIV/00216224:14330/15:00082559!RIV16-MSM-14330___ |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 24.05.2016 |
| Kontrolní číslo | 191635714 |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Podpora / návaznosti | Institucionální podpora na rozvoj výzkumné organizace Specifický výzkum na vysokých školách, poskytovatel MŠMT |
|---|