| Identifikační kód | RIV/00216224:14330/15:00080576 |
|---|
| Název v anglickém jazyce | Cell tracking accuracy measurement based on comparison of acyclic oriented graphs |
|---|
| Druh | J - Článek v odborném periodiku |
|---|
| Jazyk | eng - angličtina |
|---|
| Obor - skupina | B - Fyzika a matematika |
|---|
| Obor | BO - Biofyzika |
|---|
| Rok uplatnění | 2015 |
|---|
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
|---|
| Počet výskytů výsledku | |
|---|
| Počet tvůrců celkem | 6 |
|---|
| Počet domácích tvůrců | 5 |
|---|
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Pavel Matula (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 9465146)
Martin Maška (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 9021094)
Dmitry Sorokin (státní příslušnost: RU - Ruská federace, domácí tvůrce: A)
Petr Matula (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 8544212)
Carlos Ortiz-de-Solórzano (státní příslušnost: ES - Španělské království)
Michal Kozubek (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3021475) |
|---|
| Popis výsledku v anglickém jazyce | Tracking motile cells in time-lapse series is challenging and is required in many biomedical applications. Cell tracks can be mathematically represented as acyclic oriented graphs. Their vertices describe the spatio-temporal locations of individual cells, whereas the edges represent temporal relationships between them. Such a representation maintains the knowledge of all important cellular events within a captured field of view, such as migration, division, death, and transit through the field of view.The increasing number of cell tracking algorithms calls for comparison of their performance. However, the lack of a standardized cell tracking accuracy measure makes the comparison impracticable. This paper defines and evaluates an accuracy measure for objective and systematic benchmarking of cell tracking algorithms. The measure assumes the existence of a ground-truth reference, and assesses how difficult it is to transform a computed graph into the reference one. |
|---|
| Klíčová slova oddělená středníkem | cell tracking;acyclic graph;measure |
|---|
| Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
|---|
| DOI výsledku | 10.1371/journal.pone.0144959 |
|---|