Biochemical Space: A Framework for Systemic Annotation of Biological Models (2014)výskyt výsledku
| Identifikační kód | RIV/00216224:14330/14:00076022 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | Biochemical Space: A Framework for Systemic Annotation of Biological Models |
| Druh | D - Článek ve sborníku |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor - skupina | I - Informatika |
| Obor | IN - Informatika |
| Rok uplatnění | 2014 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 1 |
| Počet tvůrců celkem | 6 |
| Počet domácích tvůrců | 3 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Matej Klement (státní příslušnost: SK - Slovenská republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3054209) Tadeáš Děd (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6306640) David Šafránek (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 8225400) Jan Červený (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 4419715) Stefan Müller (státní příslušnost: AT - Rakouská republika) Ralf Steuer (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | In this tool paper, we target the problem of unique annotation of organism-specific computational models presented in a public model database. In particular, we present Biochemical Space, a novel annotation methodology accompanied with a set of softwaretools that allow to create, manage and maintain the Biochemical Space content. The main idea behind is to create a transparent well-annotated reaction network of chemical entities and elemental reactions onto which the mathematical models are projected.For a given organism, the Biochemical Space represents a unifying platform for understanding of the related biological processes. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | biological models; model annotation; systems biology; cyanobacteria |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
| DOI výsledku | 10.1016/j.entcs.2014.06.013 |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název sborníku | Proceedings of the 5th International Workshop on Interactions between Computer Science and Biology (CS2Bio?14) |
|---|---|
| ISBN | - |
| ISSN | 1571-0661 |
| Počet stran výsledku | 14 |
| Strana od-do | 31-44 |
| Název nakladatele | Elsevier |
| Místo vydání | Amsterdam |
| Místo konání akce | Berlin |
| Datum konání akce | 2014 |
| Typ akce podle státní příslušnosti účastníků | WRD - Celosvětová |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Masarykova univerzita / Fakulta informatiky |
|---|---|
| Dodavatel | MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Rok sběru | 2015 |
| Specifikace | RIV/00216224:14330/14:00076022!RIV15-MSM-14330___ |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 29.05.2015 |
| Kontrolní číslo | 152393918 |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Projekt podporovaný MŠMT v programu EE | EE2.3.20.0256 - Vytvoření výzkumného týmu a mezinárodního konzorcia pro počítačový model buňky sinice (2012 - 2015) |
|---|---|
| Podpora / návaznosti | Specifický výzkum na vysokých školách, poskytovatel MŠMT |