| Identifikační kód | RIV/00216224:14330/14:00075751 |
|---|
| Název v anglickém jazyce | Robustness Analysis of Stochastic Biochemical Systems |
|---|
| Druh | J - Článek v odborném periodiku |
|---|
| Jazyk | eng - angličtina |
|---|
| Obor - skupina | I - Informatika |
|---|
| Obor | IN - Informatika |
|---|
| Rok uplatnění | 2014 |
|---|
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
|---|
| Počet výskytů výsledku | 1 |
|---|
| Počet tvůrců celkem | 4 |
|---|
| Počet domácích tvůrců | 4 |
|---|
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Milan Češka (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 1846000)
David Šafránek (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 8225400)
Sven Dražan (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3111342)
Luboš Brim (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6500773) |
|---|
| Popis výsledku v anglickém jazyce | We propose a new framework for rigorous robustness analysis of stochastic biochemical systems that is based on probabilistic model checking techniques. We adapt the general definition of robustness introduced by Kitano to the class of stochastic systemsmodelled as continuous time Markov Chains in order to extensively analyse and compare robustness of biological models with uncertain parameters. The framework utilises novel computational methods that enable to effectively evaluate the robustness of models with respect to quantitative temporal properties and parameters such as reaction rate constants and initial conditions. We have applied the framework to gene regulation as an example of a central biological mechanism where intrinsic and extrinsic stochasticity plays crucial role due to low numbers of DNA and RNA molecules. Using our methods we have obtained a comprehensive and precise analysis of stochastic dynamics under parameter uncertainty. |
|---|
| Klíčová slova oddělená středníkem | stochastic models; robustness analysis; probabilistic model checking |
|---|
| Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
|---|
| DOI výsledku | 10.1371/journal.pone.0094553 |
|---|