Identifikační kód | RIV/00216224:14330/14:00074781 |
Název v anglickém jazyce | Detection of Intramolecular Tunnels Connecting Sequence of Sites in Protein Structures |
Druh | D - Článek ve sborníku |
Jazyk | eng - angličtina |
Obor - skupina | I - Informatika |
Obor | IN - Informatika |
Rok uplatnění | 2014 |
Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
Počet výskytů výsledku | 1 |
Počet tvůrců celkem | 3 |
Počet domácích tvůrců | 3 |
Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Ondřej Strnad (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6875017) Barbora Kozlíková (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5901332) Jiří Sochor (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 7676239) |
Popis výsledku v anglickém jazyce | Proteins are essential for functioning of all living organisms and studying their inner structure and functions has been of a high importance. Many studies concentrated on detection of various inner structures inside macromolecules (e.g. tunnels, channels, pores) which play an essential role in the functioning of a large number of proteins. Here we present a novel approach to a detection of intramolecular tunnels. These pathways may facilitate the transport of reaction intermediates among buried activesites. The results obtained by the proposed algorithm were compared to intramolecular tunnels whose presence in given structures is already known. The algorithm is able to also identify other inner structures, such as channels or pores. |
Klíčová slova oddělená středníkem | protein structure; tunnel; intramolecular tunnel; active site |
Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
DOI výsledku | 10.1007/978-3-319-07581-5_9 |