CAVER Analyst 1.0: Graphic tool for interactive visualization and analysis of tunnels and channels in protein structures (2014)výskyt výsledku
| Identifikační kód | RIV/00216224:14330/14:00073649 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | CAVER Analyst 1.0: Graphic tool for interactive visualization and analysis of tunnels and channels in protein structures |
| Druh | J - Článek v odborném periodiku |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor - skupina | I - Informatika |
| Obor | IN - Informatika |
| Rok uplatnění | 2014 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 3 |
| Počet tvůrců celkem | 15 |
| Počet domácích tvůrců | 14 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Barbora Kozlíková (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5901332) Eva Šebestová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 4187911) Vilém Šustr (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6902677) Jan Brezovský (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6084559) Ondřej Strnad (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6875017) Lukáš Daniel (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6975917) David Bednář (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 2652773) Antonín Pavelka (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 2475960) Martin Manak (státní příslušnost: CZ - Česká republika) Martin Bezděka (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 2988798) Petr Beneš (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5531292) Matúš Kotry (státní příslušnost: SK - Slovenská republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5016746) Artur Wiktor Gora (státní příslušnost: PL - Polská republika, domácí tvůrce: A) Jiří Damborský (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 1030175) Jiří Sochor (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 7676239) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | The transport of ligands, ions or solvent molecules into proteins with buried binding sites or through the membrane is enabled by protein tunnels and channels. CAVER Analyst is a software tool for calculation, analysis and real-time visualization of access tunnels and channels in static and dynamic protein structures. It provides an intuitive graphic user interface for setting up the calculation and interactive exploration of identified tunnels/channels and their characteristics. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | protein; visualization; tunnel; cavity |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
| DOI výsledku | 10.1093/bioinformatics/btu364 |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | Bioinformatics |
|---|---|
| ISSN | 1367-4803 |
| Svazek periodika | 30 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 18 |
| Stát vydavatele periodika | GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska |
| Počet stran výsledku | 2 |
| Strana od-do | 2684-2685 |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000342913000027 |
| EID výsledku v databázi Scopus | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Masarykova univerzita / Fakulta informatiky |
|---|---|
| Dodavatel | MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Rok sběru | 2015 |
| Specifikace | RIV/00216224:14330/14:00073649!RIV15-MSM-14330___ |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 29.05.2015 |
| Kontrolní číslo | 152393841 |
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného stejným předkladatelem
| Dodáno GA ČR v roce 2015 | RIV/00216224:14330/14:00073649 v dodávce dat RIV15-GA0-14330___/01:1 |
|---|
Informace o dalších výskytech výsledku dodaného ostatními předkladateli
| Dodáno MŠMT v roce 2015 | RIV/49777513:23520/14:43922721 v dodávce dat RIV15-MSM-23520___/01:1 předkladatelem Západočeská univerzita v Plzni / Fakulta aplikovaných věd |
|---|
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Projekt podporovaný MŠMT v programu ED | ED0001/01/01 - CETOCOEN (2010 - 2013) |
|---|---|
| Projekt podporovaný MŠMT v programu EE | EE2.3.20.0183 - Centrum experimentální biomedicíny (2012 - 2015) |
| Projekt podporovaný MŠMT v programu EE | EE2.3.30.0037 - Zaměstnáním nejlepších mladých vědců k rozvoji mezinárodní spolupráce (2013 - 2015) |
| Projekt podporovaný GA ČR v programu GA | GAP202/10/1435 - Analýza a vizualizace proteinových struktur (2010 - 2012) |
| Projekt podporovaný MŠMT v programu LC | LC06008 - Centrum počítačové grafiky (2006 - 2010) |