Segmentation and Shape Tracking of Whole Fluorescent Cells Based on the Chan-Vese Model (2013)výskyt výsledku
| Identifikační kód | RIV/00216224:14330/13:00081861 |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce | Segmentation and Shape Tracking of Whole Fluorescent Cells Based on the Chan-Vese Model |
| Druh | J - Článek v odborném periodiku |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor - skupina | E - Biovědy |
| Obor | EA - Morfologické obory a cytologie |
| Rok uplatnění | 2013 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
| Počet výskytů výsledku | 1 |
| Počet tvůrců celkem | 6 |
| Počet domácích tvůrců | 2 |
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Martin Maška (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 9021094) Ondřej Daněk (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 8900736) Saray Garasa (státní příslušnost: ES - Španělské království) Ana Rouzaut (státní příslušnost: ES - Španělské království) Arrate Mu?oz-Barrutia (státní příslušnost: ES - Španělské království) Carlos Ortiz-de-Solórzano (státní příslušnost: ES - Španělské království) |
| Popis výsledku v anglickém jazyce | We present a fast and robust approach to tracking the evolving shape of whole fluorescent cells in time-lapse series. The proposed tracking scheme involves two steps. First, coherence-enhancing diffusion filtering is applied on each frame to reduce the amount of noise and enhance flow-like structures. Second, the cell boundaries are detected by minimizing the Chan?Vese model in the fast level set-like and graph cut frameworks. To allow simultaneous tracking of multiple cells over time, both frameworks have been integrated with a topological prior exploiting the object indication function. The potential of the proposed tracking scheme and the advantages and disadvantages of both frameworks are demonstrated on 2-D and 3-D time-lapse series of rat adipose-derived mesenchymal stem cells and human lung squamous cell carcinoma cells, respectively. |
| Klíčová slova oddělená středníkem | Cell tracking; Chan?Vese model; fluorescence microscopy; graph cut optimization; level set framework |
| Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
| DOI výsledku | 10.1109/TMI.2013.2243463 |
Údaje o výsledku v závislosti na druhu výsledku
| Název periodika | IEEE Transactions on Medical Imaging |
|---|---|
| ISSN | 0278-0062 |
| Svazek periodika | 32 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 6 |
| Stát vydavatele periodika | US - Spojené státy americké |
| Počet stran výsledku | 12 |
| Strana od-do | 995-1006 |
| Kód UT WoS článku podle Web of Science | 000319701800003 |
| EID výsledku v databázi Scopus | - |
Ostatní informace o výsledku
| Předkladatel | Masarykova univerzita / Fakulta informatiky |
|---|---|
| Dodavatel | MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Rok sběru | 2016 |
| Specifikace | RIV/00216224:14330/13:00081861!RIV16-MSM-14330___ |
| Datum poslední aktualizace výsledku | 24.05.2016 |
| Kontrolní číslo | 191635479 |
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
| Projekt podporovaný MŠMT v programu EE | EE2.3.30.0009 - Zaměstnáním čerstvých absolventů doktorského studia k vědecké excelenci (2012 - 2015) |
|---|