| Identifikační kód | RIV/00216224:14330/13:00069322 |
|---|
| Název v anglickém jazyce | Geometry-based Algorithm for Detection of Asymmetric Tunnels in Protein Molecules |
|---|
| Druh | D - Článek ve sborníku |
|---|
| Jazyk | eng - angličtina |
|---|
| Obor - skupina | I - Informatika |
|---|
| Obor | IN - Informatika |
|---|
| Rok uplatnění | 2013 |
|---|
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
|---|
| Počet výskytů výsledku | 1 |
|---|
| Počet tvůrců celkem | 3 |
|---|
| Počet domácích tvůrců | 3 |
|---|
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Jan Byška (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 2313871)
Adam Jurčík (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3622487)
Jiří Sochor (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 7676239) |
|---|
| Popis výsledku v anglickém jazyce | We present a novel geometry-based method for computing asymmetric tunnels and voids in proteins, approximating their real shape with selected precision. Our method combines ideas from Voronoi and grid based approaches for protein analysis. We represent tunnels in protein using voxel data grid which allows us to store their shape more accurately. Our algorithm employs a tunnel skeleton computed using Voronoi diagram. The skeleton allows us to perform grid computation in a bounded space, with lower time and memory demands, and easily identify and measure individual tunnels. |
|---|
| Klíčová slova oddělená středníkem | voxels; protein; tunnel; computational geometry; visualization |
|---|
| Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
|---|