| Identifikační kód | RIV/00216224:14330/13:00068953 |
|---|
| Název v anglickém jazyce | In silico search for secondary structures in p53 target genes using R/Bioconductor |
|---|
| Druh | D - Článek ve sborníku |
|---|
| Jazyk | eng - angličtina |
|---|
| Obor - skupina | I - Informatika |
|---|
| Obor | IN - Informatika |
|---|
| Rok uplatnění | 2013 |
|---|
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
|---|
| Počet výskytů výsledku | 1 |
|---|
| Počet tvůrců celkem | 3 |
|---|
| Počet domácích tvůrců | 1 |
|---|
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Marie Brázdová (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 8312095)
Tomáš Martínek (státní příslušnost: CZ - Česká republika, vedidk: 4123484)
Matej Lexa (státní příslušnost: SK - Slovenská republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6759890) |
|---|
| Popis výsledku v anglickém jazyce | p53 is a well-known transcription factor and tumor suppressor, regulating among other processes, the commitment of cells to apoptosis and DNA repair. p53 mutants are often found in cancers of different kinds, ei- ther as mutant or misregulated p53. p53 is involved in many other processes and we currently do not understand the full range of its functions. It is known to recognize the p53con sequence by its specific DNA-binding domain (DBD). It is also known to bind DNA non-specifically. This binding hasbeen shown to involve superhelical DNA, more specifically, cruciform, triplex and quadruplex struc- tures. In our laboratories we were intrigued by the possi- ble interplay between non-canonical DNA structure bind- ing and regular p53con binding. In an attempt to clarify this interplay and discover suitable candidate genes for fur- ther study, we carried out an in silico study on the human genome. |
|---|
| Klíčová slova oddělená středníkem | R/bioconductor; p53; bioinformatika; analýza sekvence DNA |
|---|
| Stránka www, na které se nachází výsledek | https://www.researchgate.net/publication/254257375_In_silico_search_for_secondary_structures_in_p53_target_genes_using_RBioconductor?ev=prf_pub |
|---|