| Identifikační kód | RIV/00216224:14330/13:00066457 |
|---|
| Název v anglickém jazyce | Real-time Visualization and Exploration of Protein Empty Space with Varying Parameters |
|---|
| Druh | J - Článek v odborném periodiku |
|---|
| Jazyk | eng - angličtina |
|---|
| Obor - skupina | I - Informatika |
|---|
| Obor | IN - Informatika |
|---|
| Rok uplatnění | 2013 |
|---|
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
|---|
| Počet výskytů výsledku | 2 |
|---|
| Počet tvůrců celkem | 4 |
|---|
| Počet domácích tvůrců | 4 |
|---|
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Ondřej Strnad (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6875017)
Barbora Kozlíková (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5901332)
Vilém Šustr (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6902677)
Jiří Sochor (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 7676239) |
|---|
| Popis výsledku v anglickém jazyce | Long-term research in the area of protein analysis proved the importance of an empty space situated inside these macromolecular structures. This empty space influences the protein function, characteristics or reactivity. Many algorithms enabling computation of these empty spaces (or voids) have been published and their results were evaluated by protein engineers to confirm their chemical relevance. However, not all detected voids inside protein are of the same importance. Thus, the examination and assessment of all voids must follow to reveal the important ones. In this phase the visual representation of voids is very valuable and substantially decreases the time spent in this evaluation phase. In this paper we present an extension of the algorithm forthe visualization and further evaluation of protein voids in real-time. The user-driven approach enables to compute and display empty space that satisfies the input parameters instantly. |
|---|
| Klíčová slova oddělená středníkem | protein; empty space; void; visualization; real-time; cavity; volume; Voronoi diagram; Delaunay triangulation |
|---|
| Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
|---|