| Identifikační kód | RIV/00216224:14330/13:00066280 |
|---|
| Název v anglickém jazyce | Exploring Parameter Space of Stochastic Biochemical Systems Using Quantitative Model Checking |
|---|
| Druh | D - Článek ve sborníku |
|---|
| Jazyk | eng - angličtina |
|---|
| Obor - skupina | I - Informatika |
|---|
| Obor | IN - Informatika |
|---|
| Rok uplatnění | 2013 |
|---|
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
|---|
| Počet výskytů výsledku | 2 |
|---|
| Počet tvůrců celkem | 4 |
|---|
| Počet domácích tvůrců | 4 |
|---|
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Luboš Brim (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6500773)
Milan Češka (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 1846000)
Sven Dražan (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 3111342)
David Šafránek (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 8225400) |
|---|
| Popis výsledku v anglickém jazyce | We propose an automated method for exploring kinetic parameters of stochastic biochemical systems. The main question addressed is how the validity of an a priori given hypothesis expressed as a temporal logic property depends on kinetic parameters. Our aim is to compute a landscape function that, for each parameter point from the inspected parameter space, returns the quantitative model checking result for the respective continuous time Markov chain. Since the parameter space is in principle dense, it is infeasible to compute the landscape function directly. Hence, we design an effective method that iteratively approximates the lower and upper bounds of the landscape function with respect to a given accuracy. To this end, we modify the standard uniformization technique and introduce an iterative parameter space decomposition. We also demonstrate our approach on two biologically motivated case studies. |
|---|
| Klíčová slova oddělená středníkem | continuous-time Markov chains; parameter exploration; model checking |
|---|
| Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
|---|
| DOI výsledku | 10.1007/978-3-642-39799-8_7 |
|---|