| Identifikační kód | RIV/00216224:14330/13:00065959 |
|---|
| Název v anglickém jazyce | Real-time visualization of protein empty space with varying parameters |
|---|
| Druh | D - Článek ve sborníku |
|---|
| Jazyk | eng - angličtina |
|---|
| Obor - skupina | I - Informatika |
|---|
| Obor | IN - Informatika |
|---|
| Rok uplatnění | 2013 |
|---|
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
|---|
| Počet výskytů výsledku | 2 |
|---|
| Počet tvůrců celkem | 4 |
|---|
| Počet domácích tvůrců | 4 |
|---|
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Ondřej Strnad (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6875017)
Vilém Šustr (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6902677)
Barbora Kozlíková (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 5901332)
Jiří Sochor (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 7676239) |
|---|
| Popis výsledku v anglickém jazyce | Exploration of empty space inside protein structures is playing a crucial role in protein engineering and drug design. Such empty space inside protein can be utilized for design of protein mutations. The importance of empty space is also based on its ability to accept a small ligand molecule which can react with the protein. The product of such reaction can form a basis of new medications. Many algorithms enabling computation of these empty spaces, often marked as voids, have been published and their results were evaluated by protein engineers to confirm their chemical relevance. However, not each void of the protein can be considered as a target point of ligand binding. Thus the following examination and assessment of all voids has to be performed. Inthis phase the visual representation of voids is very valuable and substantially decreases time of this evaluation phase. In this paper, we introduce a novel algorithm for visualization and further evaluation of voids in real-time. |
|---|
| Klíčová slova oddělená středníkem | protein; empty space; void; visualization; real-time; cavity |
|---|
| Stránka www, na které se nachází výsledek | - |
|---|