| Identifikační kód | RIV/00216224:14330/12:00057781 |
|---|
| Název v anglickém jazyce | Parameter Identification and Model Ranking of Thomas Networks |
|---|
| Druh | D - Článek ve sborníku |
|---|
| Jazyk | eng - angličtina |
|---|
| Obor - skupina | I - Informatika |
|---|
| Obor | IN - Informatika |
|---|
| Rok uplatnění | 2012 |
|---|
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
|---|
| Počet výskytů výsledku | 2 |
|---|
| Počet tvůrců celkem | 5 |
|---|
| Počet domácích tvůrců | 3 |
|---|
| Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | Hannes Klarner (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo)
Adam Streck (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6717020)
David Šafránek (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 8225400)
Juraj Kolčák (státní příslušnost: SK - Slovenská republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 1045709)
Heike Siebert (státní příslušnost: DE - Spolková republika Německo) |
|---|
| Popis výsledku v anglickém jazyce | We propose a new methodology for identification and analysis of discrete gene networks as defined by René Thomas, supported by a tool chain: (i) given a Thomas network with partially known kinetic parameters, we reduce the number of acceptable parametrizations to those that fit time-series measurements and reflect other known constraints by an improved technique of coloured LTL model checking performing efficiently on Thomas networks in distributed environment; (ii) we introduce classification of acceptable parametrizations to identify most optimal ones; (iii) we propose two ways of visualising parametrizations dynamics wrt time-series data. Finally, computational efficiency is evaluated and the methodology is validated on bacteriophage lambda case study. |
|---|
| Klíčová slova oddělená středníkem | Thomas network; parameter identification; model checking |
|---|
| Stránka www, na které se nachází výsledek | http://link.springer.com/chapter/10.1007/978-3-642-33636-2_13 |
|---|
| DOI výsledku | 10.1007/978-3-642-33636-2_13 |
|---|