Identifikační kód | RIV/00216224:14330/11:00052210 |
Název v anglickém jazyce | Generation of 3D Digital Phantoms of Colon Tissue |
Druh | D - Článek ve sborníku |
Jazyk | eng - angličtina |
Obor - skupina | J - Průmysl |
Obor | JD - Využití počítačů, robotika a její aplikace |
Rok uplatnění | 2011 |
Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje o výsledku nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů. |
Počet výskytů výsledku | 2 |
Počet tvůrců celkem | 3 |
Počet domácích tvůrců | 3 |
Výčet všech uvedených jednotlivých tvůrců | David Svoboda (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 6056229) Ondřej Homola (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 2609088) Stanislav Stejskal (státní příslušnost: CZ - Česká republika, domácí tvůrce: A, vedidk: 2346257) |
Popis výsledku v anglickém jazyce | Although segmentation of biomedical image data has been paid a lot of attention for many years, this crucial task still meets the problem of the correctness of the obtained results. Especially in the case of optical microscopy, the ground truth (GT), which is a very important tool for the validation of image processing algorithms, is not available. We have developed a toolkit that generates fully 3D digital phantoms, that represent the structure of the studied biological objects. While former papers concentrated on the modelling of isolated cells (such as blood cells), this work focuses on a representative of tissue image type, namely human colon tissue. This phantom image can be submitted to the engine that simulates the image acquisition process. Such synthetic image can be further processed, e.g. deconvolved or segmented. The results can be compared with the GT derived from the digital phantom and the quality of the applied algorithm can be measured. |
Klíčová slova oddělená středníkem | Digital phantom; Colon tissue; Simulation; Haralick texture features |
Stránka www, na které se nachází výsledek | - |